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BOREA research unit programs

International Research Programs

Team 2: Reproduction and development of aquatic organisms: evolution, adaptation, regulations

Eel genome project

2010 to 2016

The eel genome project has been founded by an international consortium (Netherlands, France, Japan, Norway).

The draft genomes of two eel species, the European eel, Anguilla anguilla, and the Japanese eel, Anguilla japonica, have been sequenced using the Illumina method.

The ongoing project includes further assembly of the European eel genome by using ew methodologies for direct sequencing and analysis of Megabase size DNA.

The consortium is also organising international conferences and workshops on eel genomics and transcriptomics.

Team 4: Larval dispersal and communities organization in austral and tropical island systems

Project Melanesia-Hotspot

2015 to 2017

The main objective of our project is to inventory in CEPF (Critical Ecosystem Partnership Fund) priority sites freshwater fish and crustaceans in Solomon and Vanuatu in order to fill the gaps identified at IUCN Redlisting workshop. It will propose management solutions that will assist environmental managers, land-owners, local communities and all those interested in sustainable freshwater management. This work will provide help:

Team 5: Diversity and interactions in coastal ecosystems

Team 6: Source and transfer of organic matter in aquatic ecosystems

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European research programs

Team 2: Reproduction and development of aquatic organisms: evolution, adaptation, regulations

PRO-EEL

2010 to 2015

7th PCRD Programme "Food, Agriculture and Fisheries, and Biotechnology" KBBE-2009-1-2-13, n° 245257

The PRO-EEL project aims at breeding European eel (Anguilla anguilla) in captivity. Reproduction of eel in culture has become a focus research area due a severe decline of natural stocks and an increasing interest to breed eels for a self-sustained aquaculture. PRO-EEL is an international research project supported financially by the European Commission.

REPROSEED

2009 to 2014

The key objective of the REPROSEED project is to support the capacity of European hatcheries to respond to an increasing demand for mollusc seed. Hatchery seed production of Pacific oyster (Crassostrea gigas) is already well established, while for other species (Mytilus edulis, M. galloprovincialis, Ruditapes decussatus, Pecten maximus) it remains limited due to market or biological bottlenecks.

Team 3: Adaptations to Extreme Environments

MIDAS

2014 to 2016

The ecotoxicological risks posed by deep-sea mineral extraction are complex and poorly known. Heavy metals, trace metals and Rare Earth Elements (REEs) phases may be subject to considerable alteration in the marine environment during the mining and at-sea processing of minerals. MIDAS will focus on issues related to the mining of minerals, where there is an urgent demand for information.

Team 5: Diversity and interactions in coastal ecosystems

RECIF

2013 to 2015

Le projet RECIF s’inscrit dans le cadre des réflexions et des actions pour l’amélioration de l’écosystème et pour une meilleure gestion des ressources marines de part et autre de la Manche. Pour répondre à ces enjeux économiques, environnementaux majeurs ce projet vise plusieurs objectifs : valorisation des ressources et coproduits marins (coquilles vides), développement de matériaux de construction innovants pour récifs artificiels et mise en place de récifs artificiels pour l’amélioration de la biodiversité et de la production de l’écosystème marin en Manche.

RECIF

2013 to 2015

Le projet RECIF s’inscrit dans le cadre des réflexions et des actions pour l’amélioration de l’écosystème et pour une meilleure gestion des ressources marines de part et autre de la Manche. Pour répondre à ces enjeux économiques, environnementaux majeurs ce projet vise plusieurs objectifs : valorisation des ressources et coproduits marins (coquilles vides), développement de matériaux de construction innovants pour récifs artificiels et mise en place de récifs artificiels pour l’amélioration de la biodiversité et de la production de l’écosystème marin en Manche.

EELIAD

2008 to 2012

Projet européen dont l’objectif est de résoudre l’énigme des phases marines de l’anguille européenne grâce à un vaste programme de marquage d’anguilles avec des balises largables (Pop-ups tags).

Responsabilité de WP  visant à comprendre le lien entre traits reproducteurs, caractéristiques des bassins versants, et contamination par les métaux lourds et les polluants organiques persistants.

Programme euroépen FP7-Environnement 

EELIAD

2008 to 2012

Projet européen dont l’objectif est de résoudre l’énigme des phases marines de l’anguille européenne grâce à un vaste programme de marquage d’anguilles avec des balises largables (Pop-ups tags).

Responsabilité de WP  visant à comprendre le lien entre traits reproducteurs, caractéristiques des bassins versants, et contamination par les métaux lourds et les polluants organiques persistants.

Programme euroépen FP7-Environnement 

Team 6: Source and transfer of organic matter in aquatic ecosystems

BIO-Tide)

2017 to 2020

The role of microbial biodiversity in the functioning of marine tidal flat sediments (BIO-Tide) is an Horizon 2020 ERA-NET COFUND project financed by the Biodiversa program. The aim of the project is to bring together scientists and stakeholders in studying the relationships between microbial diversity and ecosystem functioning/services in intertidal environments

The project will be articulated in 7 work packages (WPs; overall rationale see our website at bio-tide.eu).

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National and Regional Research Programs

Team 1: Evolution of Biomineralizations and Adaptations to Environmental Constraints , Inter-teams

Team 2: Reproduction and development of aquatic organisms: evolution, adaptation, regulations

ATM SEPIOM

2015 to 2016

In cephalopod coleoid lineage, sepiids show an internal shell with two distinct parts: dorsal shield and phragmocone. Its mineral composition (aragonite) is well known but organic components, especially proteins, remain to be determined. We propose in this project to 1) identify the proteins  in organic fractions from dorsal shield and phragmocone 2) analyse gene expression of each part of shell sac (dorsal and ventral) and 3) determine if some identified components show similar enzymatic activities to those of other molluscs.

ANR SalTemp

2013 to 2017

ANR SALTEMP  "Global warming and adaptation of migration in Atlantic salmon from long river Loire-Allier Axis"/“Réchauffement global et adaptation à la migration chez le saumon atlantique de longue rivière, l’axe Loire-Allier”

Programme ANR BIOADAPT (Adaptation des gènes aux populations. Génétique et biologie de l’adaptation aux stress et aux perturbations)

Ref Projet: ANR-12-ADAP-0021

PEPTISAN

2012 to 2014

The PEPTISAN project, labeled by the Pôle Mer Bretagne, aims to identify bioactive molecules for therapeutic uses from organs of the small spotted catshark. It is a joined project between the UMR BOREA, the Station Biologique de Roscoff, the Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes and the society KELIA of Saint-Malo. Its objectives are the characterization and preclinical development of molecules involved in the regulation of normal and pathological physiological functions based, in particular, on genomic data and the development of vector systems.

K4AQUA

K4aqua- bacteria + K4
2012 to 2014

The objective of this project is to evaluate the potential of the antibacterial peptide K4 (FR 0709057) particularly active against marine Vibrio in aquaculture farms. Targeted investigations will test its safety on various marine organisms, its effectiveness in the context of controlled infection and its persistence in the environment.

Works were financed by the Regional Council of Basse Normandie.

Team 4: Larval dispersal and communities organization in austral and tropical island systems

POKER 4

Carte des stations de chalutage prévues pour POKER 4 (septembre 2017) aux îles Kerguelen.
2017

Le plateau de Kerguelen est le plus grand de l’océan Austral et abrite des populations de poissons, en partie endémiques, très importantes écologiquement et économiquement. Près de 19 espèces démersales (dont deux exploitées commercialement) sont ainsi suivies lors des campagnes synoptiques POKER (initiées en 2006, soit 200 stations revisitées à intervalles réguliers) afin de comprendre l’évolution de l’écosystème. Un travail d’écorégionalisation benthique est associé aux études ichtyologiques ce qui constitue une première approche dans le cadre de la promotion d’aires marines protégées.

Impact of ocean acidification on reproduction and early development of the abalone Haliotis tuberculata

2017 to 2018

As a consequence of global change, mean surface temperature is projected to increase by 1 to 3°C while surface ocean pH should decrease by 0.1 to 0.3 units for the late 21st century. Marine ecosystems and global production of marine resources may therefore be seriously impacted by these environmental changes. Because they use calcium carbonate (CaC03) to produce their calcareous shell, marine molluscs are among the most vulnerable invertebrates to acidification.

PIGE

Trait quasi-monospécifique de poisson des glaces lors de la campagne PIGE (trait 55, octobre 2015). photo ©TAAF -Marc Le Ménager
2015 to 2016

Le poisson des glaces Champsocephalus gunnari, poisson à sang incolore (sans hémoglobine) et possédant des protéines anti-gel, ne se rencontre en abondance qu’en Géorgie du sud et sur le Plateau de Kerguelen soit les secteurs atlantique et indien de l’océan Austral. A Kerguelen son abondance varie énormément en fonction de la force de cohortes tri-annuelles. Après une phase de surexploitation intense dans les années 1990, cette espèce n’a plus fait l’objet de pêche mais c’est seulement ces dernières années que les prémices de récupération sont notées.

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