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Equipe 7 : Biodiversité, macroécologie et aquaculture

Goujon Asiatique Pseudorasbora parva, invasif et vecteur d’un champignon pathogène.
Echantillonnage en grand milieu

Thème général

Au sein de l’équipe 7,  les recherches se focalisent sur les communautés  aquatiques d’eau douce, leur dynamique naturelle et sous l’action du changement global (axe macro-écologie et changement global) ainsi que l’effet en retour de la biodiversité aquatique vers les populations humaines (ressources biologiques, maladies émergentes) (axe services de la biodiversité).

Axes de recherche

Macro-écologie et changement global.

Dans cet axe sont analysées les conséquences du changement global (changement climatique, introductions biologiques, modification et dégradation de l’habitat, exploitation des ressources) sur la dynamique des communautés aquatiques en privilégiant une approche macro-écologique. Cette démarche non-expérimentale et comparative utilise largement  les « expériences naturelles » pour identifier les facteurs de structuration des communautés en combinant les apports de l’écologie, de la biogéographie, de la paléontologie et de la phylogénétique et orienter des approches plus expérimentales ou plus locales.

Services de la biodiversité.

Dans cet axe on s’intéresse aux  liens existant entre biodiversité des eaux douces et  populations humaines au travers de l’usage de ressources biologiques et de l’émergence de maladies.  Un premier objectif est de fournir les outils scientifiques pour développer  une aquaculture respectueuse de l’environnement pour des espèces d’intérêt commercial afin de limiter les pressions humaines sur leurs populations naturelles.  Les recherches se focalisent sur le bassin amazonien en collaboration avec  des équipes péruviennes et boliviennes. Un deuxième objectif est l’étude de la contribution des habitats aquatiques, leur biodiversité et leur utilisation par l’homme à l’émergence ou le maintien de maladies humaines.  En collaboration avec l’UMR MIVEGEC (Montpellier) Les recherches se focalisent sur l’ulcère de Buruli, une maladie tropicale possiblement transmise par des insectes aquatiques.

Programmes de recherche

Type de programme Intitulé complet Période
TDSB National/Régional Valoriser les collections d'histoire naturelle et les expéditions naturalistes pour la conservation et la gestion des milieux profonds. Le cas unique du programme Tropical Deep-Sea Benthos 2017 - 2019
ODYSSEUS Européen Between Scylla and Charybdis – managing connectivity for freshwater fish 2017 - 2019
LARVAplus International LARVAplus « Stratégies de développement et amélioration de la production de larves de poissons en Ibéro-Amérique » 2017 - 2020
LARVAMAZ International Biodiversité et écologie amazoniennes : apport du métabarcoding appliqué aux larves de poissons 2016 - 2017
AMAZONFISH International Amazonian fishes and climate change - AMAZONFISH 2016 - 2018
LMI EDIA International Laboratoire Mixte International "Evolution et Domestication de l'Ichtyofaune Amazonienne" 2016 - 2020
Application de marqueurs moléculaires pour la caractérisation des poissons amazonien d’intérêt commercial (pour la consommation humaine ou l’aquariophilie) et leur application dans le suivi des exportations, du commerce et de la gestion International Application de marqueurs moléculaires pour la caractérisation des poissons amazonien d’intérêt commercial (pour la consommation humaine ou l’aquariophilie) et leur application dans le suivi des exportations, du commerce et de la gestion 2015 - 2017
FINCyt Pérou International Projet FINCyt au Pérou 2015 - 2017
FRESH National/Régional Mega measure of freshwater biodiversity: Implications in our understanding of infectious disease emergence 2014
MINAM International Systématique et organisation populationnelle d'Arapaima gigas en Amazonie péruvienne 2014 - 2015
FINCyt International Comportement reproducteur d'Arapaima gigas en milieu expérimental, gestion des alevins et nutrition 2014 - 2016
Shading light on the migration patterns of Brachyplatystoma species in the Madeira/Solimões basins using otolith 87SR/86Sr ratios International Shading light on the migration patterns of Brachyplatystoma species in the Madeira/Solimões basins using otolith 87SR/86Sr ratios 2014 - 2017
PROBIS Européen Heterogeneity of patterns and processes along biological invasion successions 2014 - 2017
BIOHOPSYS National/Régional Biodiversité et dynamique des interactions dans des systèmes multi-hôtes-parasites 2014 - 2017
DIADEMA National/Régional DIssecting Amazonian Diversity by Enhancing a Multiple taxa Approach 2014 - 2017
GENESIS National/Régional Le rôle de la diversité génétique et de la plasticité phénotypique dans l’adaptation aux changements environnementaux: une approche génomique de l’invasion biologique. 2014 - 2018
IRBAS National/Régional Analyse et Synthèse de la Biodiversité des Rivières Intermittentes 2013 - 2015
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Articles scientifiques

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Moteur de recherche Bibliographie

2015
Oberdorff T, Jézéquel C, Campero M, et al. (2015) Opinion Paper: how vulnerable are Amazonian freshwater fishes to ongoing climate change?. Journal of Applied Ichthyology 31:4-9. doi: doi: 10.1111/jai.12971
Pelayo-Villamil P, Guisande C, Vari RP, et al. (2015) Global diversity patterns of freshwater fishes - potential victims of their own success. Diversity and Distributions 21:345–356. doi: 10.1111/ddi.12271
Villéger S, Blanchet S, Beauchard O, et al. (2015) From current distinctiveness to future homogeneization of the world’s freshwater fish faunas. Diversity and Distributions 21:223-235. doi: DOI: 10.1111/ddi.12242
2014

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