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Equipe 2 : Reproduction et Développement des Organismes Aquatiques : évolution, adaptation et régulations

AXE 1 : Gonade d'huître
AXE 2 : Récepteur dopaminergique dans le cerveau d’anguille

Thème général

L’enjeu du projet est de comprendre les mécanismes moléculaires et physiologiques des fonctions de reproduction (différenciation, déterminisme du sexe, contrôle des gamétogenèses et de l'émission des gamètes, contrôle des métabolismes énergétiques associés) et du développement (organogenèse, neurogenèse et myogenèse). Cette approche intègre le rôle des facteurs environnementaux dans ces régulations (mécanismes épigénétiques). Les données génomiques et les approches fonctionnelles développées récemment sur nos modèles (huître, seiche, roussette, anguille) associées aux nouvelles méthodologies d’analyse haut débit sont des atouts pour mener à bien ces objectifs et nourrir les hypothèses évolutives.

Axes de recherche

  1. Régulation génétique et épigénétique du développement et de la reproduction

    Nous étudions les mécanismes moléculaires qui contrôlent le développement et la reproduction. Ces études se font à deux échelles d’analyse : 1) celle des gènes et des réseaux de gènes susceptibles d’intervenir dans les processus morphologiques et physiologiques ; 2) celle des mécanismes responsables de l’expression de ces gènes. Sur les deux niveaux, les facteurs environnementaux au sens large sont susceptibles d’intervenir. L’objectif est d'analyser par une approche comparative le rôle de ces gènes et de leurs régulations amont au cours de : 1) l’organogenèse, dont la neurogenèse qui constitue le point clé de l’adaptation des organismes à leur milieu ; 2) la gamétogenèse et l’influence de l’environnement, local (comme la niche des cellules souches) et externe à l’organisme. La prise en compte des facteurs environnementaux est une composante inhérente d’un des axes transversaux de l’UMR.

  2. Contrôle (neuro)hormonal du développement et de la reproduction

    Le système nerveux central, principal intégrateur des paramètres du milieu coordonne et adapte les principaux processus physiologiques animaux par l’action de neurorégulateurs libérés à proximité des cellules cibles ou sécrétés dans le système circulatoire pour agir sur des cellules cibles distantes. Les neuropeptides comptent parmi les principaux neurorégulateurs apparus très tôt au cours de l’évolution animale. L’émergence de la génomique et des nouvelles technologies de séquençage d’ADN et de protéines rendent possible l’analyse de ces systèmes régulateurs par une approche évolutive et comparée concernant plusieurs modèles animaux d’intérêt aquacole et situés à des positions clés dans l’arbre phylogénétique animal (Chondrichtyen : roussette ; Téléostéen : anguille ; Mollusques bivalves et céphalopodes : Huitre creuse et Seiche commune respectivement et Cnidaire : Euphyllia).

L’UMR BOREA a soutenu les projets incitatifs collaboratifs "Sud-Outre Mer" suivants :

- « Evolution des poissons cavernicoles dans la région karstique du Cerro Blanco » (co-resp. : Marc Pouilly, Eq6 Pérou, Sébastien Baratte, Eq2 Paris et Max Hidalgo, Museo de Historia Natural de Lima (Université de San Marcos), Pérou) : 2018. PDF

- « Peptides sécrétagogues de l’hormone de croissance chez les espèces d’intérêt aquacole : abord des effets neuroendocrines directs hypophysaires chez les téléostéens » (co-resp. Sylvie Dufour, EQ2 Paris et Karine Rousseau, EQ2 Paris / Participants : Pascal Favrel, EQ2 Caen et Pascal Sourdaine, EQ2 Caen et Dr Rebeca Martinez et Liz Hernadez, CIGB (Centro de Ingenieria Genetica y Biotechnologia de Cuba), la Havane, Cuba) : 2018. PDF

Programmes de recherche

Type de programme Intitulé complet Période
Yuschan Schoolar Program Taiwan International Evolutionary endocrinology of marine organisms 2020 - 2023
HERITAGe National/Régional HERitabilité, épITranscriptome et Adaptation chez l’huître C. Gigas Effets de contaminants émergents, microplastiques et microalgues toxiques, sur le développement de l'huître via héritabilité épigénétique par méthylation de l'ARN 2019 - 2020
DIM1Health National/Régional Anti-infectious and trans-species neuroendocrine effects of fish antimicrobial neuropeptides in rainbow trout, European eel using an in vitro genome editing platform 2019 - 2020
PHC Finlay France-Cuba International Growth hormone secretagogues and fish neuro-immunoendocrinoogy for sustainable aquaculture and conservation 2019 - 2020
UPSIDE National/Régional UV effects & pigments during Sepia officinalis development 2019 - 2021
JSPS 2018 LIGHTOME, France-Japon International Comparative study of light perception in two cephalopod species: Sepia officinalis and Idiosepius paradoxus 2018
MATO National/Régional Maturité objective des poissons par l'histologie quantitative - projet politique de site IFREMER 2018 - 2019
ECUME National/Régional Etude Intégrée Multi-Echelles d’Ecosystèmes côtiers 2018 - 2021
ATM LOCUS National/Régional Première LOcalisation ChromosomiqUe de gènes du déterminisme du Sexe chez les mollusques - approche comparative chez l’huître Crassostrea gigas et la seiche Sepia officinalis 2017 - 2018
Salinité huitres National/Régional Salinité - Etude de la salinité de l’eau de stockage sur la composition biochimique et la texture de la chair des huîtres ainsi que sur leurs caractéristiques organoleptiques. Convention CRBN Actions en faveur du développement économique de la filière re 2017 - 2019
OLICEB International OLICEB : OLfaction In CEphalopod Brain 2016
DEVEOP (Picard+) National/Régional Extraocular photoreception in aquatic species and its developmental control: a comparison between amphioxus and cuttlefish 2016
DEVO-LU puis LEDS National/Régional Rôle de la lumière sur le développement du système visuel des embryons et le comportement des juvéniles de Sepia officinalis 2016 - 2017
Biligncell National/Régional Mise en place d'une lignée cellulaire de bivalve - Convention CRBN Actions en faveur du développement économique de la filière ressources marines 2016 - 2019
ATM SEPIOM National/Régional Evolution de la coquille chez les Mollusques : approche descriptive des composés organiques impliqués dans la synthèse coquillière de la seiche, Sepia officinalis (Céphalopode) 2015 - 2016
DYNA International Dynamique de la neurogenèse chez la seiche Sepia officinalis 2015 - 2016
DESYNCHRO National/Régional Changements globaux et désynchronisation du cycle de vie du saumon de Loire : mécanismes et enjeux pour la conservation 2015 - 2016
BestClim National/Régional Buccin espèce sentinelle pour le climat - Convention CRBN 2015 PCM 22 Synergies Partenariale et Actions Novatrices 2015 - 2016
ITN IMPRESS Européen Improved production strategies for the conservation and management of endangered freshwater fish 2015 - 2018
ANR NEMO International Neuropeptides of Marine organisms 2015 - 2019
MANCHE 2012 National/Régional CPER MANCHE 2012 2015 - 2020
ATM YEUX National/Régional Développement des yeux chez l’embryon de Seiche, Sepia officinalis et évolution des photorécepteurs 2014
ATM PIGMENT National/Régional Quels pigments cache la seiche ? 2014
MADREPOP National/Régional Mécanismes de l'adaptation et de la résilience des populations exploitées 2014 - 2015
ATM CRISPR National/Régional Mise au point d’une technique d’invalidation de gène chez deux organismes aquatiques non-conventionnels, la seiche Sepia officinalis et l’huître Crassostrea gigas 2014 - 2015
REPRO-TEMP France-Espagne International The European Eel as a model to study the temperature a a modulator of the sexual maturation in teleots. Potential application in Aquaculture 2014 - 2017
Global Networking Talent, MoST Taiwan International Taiwan-France Exchange Program 2014 - 2017
Buloclim National/Régional Effets des changements climatiques sur le bulot. Convention CRBN 2013 PCM 14 Synergies Partenariale et Actions Novatrices 2013 - 2014
TRIPLOIDES National/Régional Blocage de la reproduction des huitres triploïdes : mécanisme sous-jacent et impact de l’environnement – Convention CRBN 2013-PCM 04 Synergies Partenariale et Actions Novatrices 2013 - 2015
NAISSAIN National/Régional Etude de l’état physiologique du naissain d’huître - Convention CRBN 2013-PCM 05 Synergies Partenariale et Actions Novatrices 2013 - 2015
COST AQUAGAMETE Européen Assessing and improving the quality of aquatic animal gametes to enhance aquatic resources 2013 - 2016
ANR SalTemp National/Régional Global warming and adaptation of migration in Atlantic salmon from long river Loire-Allier Axis 2013 - 2017
PEPTISAN National/Régional Projet de développement de peptides thérapeutiques issus de la roussette (Scyliorhinus canicula), Région Basse-Normandie – FEDER 2890/33528 2012 - 2014
K4AQUA National/Régional Potentiel d’exploitation du peptide anti‐bactérien K4 dans les élevages aquacoles 2012 - 2014
GIMEPEC National/Régional Génotoxicité immunotoxicité et repro-toxicité des pesticides chez C. gigas. ANR 11-CESA 0016 2012 - 2016
Alosa alosa Européen Conservation and restoration of the Allis shad in the Gironde and Rhine watersheds 2011 - 2016
Eel genome project International International Consortium: The Eel genome project 2010
ANR IMMORTEEL International IMpacts of Metallic and ORganic contaminations of the Gironde and St Laurent systems on two Threatened species, the European and American EELs 2010 - 2014
PRO-EEL Européen Reproduction of European eel: towards a sustained aquaculture 2010 - 2015
REPROSEED Européen REsearch to improve PROduction of SEED of established and emerging bivalve species in European hatcheries, FP7 245119 2009 - 2014
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Articles scientifiques

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Moteur de recherche Bibliographie

2016
PDF icon Jolly_jne_12411_Rev_EV.PDF (637.36 Ko)
PDF icon LafontGCE2016.pdf (2.78 Mo)
PDF icon Lin_et_al-2016-Developmental_Neurobiology.pdf (1.04 Mo)
PDF icon Lin_et_al-2016-Developmental_Neurobiology.pdf (1.04 Mo)
PDF icon Mazzeo_et_al-2016-Journal_of_Fish_Biology.pdf (1.12 Mo)
2015
PDF icon Baillon_Chemosphere2015.pdf (490.11 Ko)
Cornet V, Henry J, Corre E, et al. (2015) The Toll/NF-κB pathway in cuttlefish symbiotic accessory nidamental gland. Dev Comp Immunol 53:42-46. doi: 10.1016/j.dci.2015.06.016

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