L’enjeu du projet est de comprendre les mécanismes moléculaires et physiologiques des fonctions de reproduction (différenciation, déterminisme du sexe, contrôle des gamétogenèses et de l'émission des gamètes, contrôle des métabolismes énergétiques associés) et du développement (organogenèse, neurogenèse et myogenèse). Cette approche intègre le rôle des facteurs environnementaux dans ces régulations (mécanismes épigénétiques). Les données génomiques et les approches fonctionnelles développées récemment sur nos modèles (huître, seiche, roussette, anguille) associées aux nouvelles méthodologies d’analyse haut débit sont des atouts pour mener à bien ces objectifs et nourrir les hypothèses évolutives.
Régulation génétique et épigénétique du développement et de la reproduction
Nous étudions les mécanismes moléculaires qui contrôlent le développement et la reproduction. Ces études se font à deux échelles d’analyse : 1) celle des gènes et des réseaux de gènes susceptibles d’intervenir dans les processus morphologiques et physiologiques ; 2) celle des mécanismes responsables de l’expression de ces gènes. Sur les deux niveaux, les facteurs environnementaux au sens large sont susceptibles d’intervenir. L’objectif est d'analyser par une approche comparative le rôle de ces gènes et de leurs régulations amont au cours de : 1) l’organogenèse, dont la neurogenèse qui constitue le point clé de l’adaptation des organismes à leur milieu ; 2) la gamétogenèse et l’influence de l’environnement, local (comme la niche des cellules souches) et externe à l’organisme. La prise en compte des facteurs environnementaux est une composante inhérente d’un des axes transversaux de l’UMR.
Contrôle (neuro)‐hormonal du développement et de la reproduction
Le système nerveux central, principal intégrateur des paramètres du milieu coordonne et adapte les principaux processus physiologiques animaux par l’action de neurorégulateurs libérés à proximité des cellules cibles ou sécrétés dans le système circulatoire pour agir sur des cellules cibles distantes. Les neuropeptides comptent parmi les principaux neurorégulateurs apparus très tôt au cours de l’évolution animale. L’émergence de la génomique et des nouvelles technologies de séquençage d’ADN et de protéines rendent possible l’analyse de ces systèmes régulateurs par une approche évolutive et comparée concernant plusieurs modèles animaux d’intérêt aquacole et situés à des positions clés dans l’arbre phylogénétique animal (Chondrichtyen : roussette ; Téléostéen : anguille ; Mollusques bivalves et céphalopodes : Huitre creuse et Seiche commune respectivement et Cnidaire : Euphyllia).
- « Evolution des poissons cavernicoles dans la région karstique du Cerro Blanco » (co-resp. : Marc Pouilly, Eq6 Pérou, Sébastien Baratte, Eq2 Paris et Max Hidalgo, Museo de Historia Natural de Lima (Université de San Marcos), Pérou) : 2018. PDF
- « Peptides sécrétagogues de l’hormone de croissance chez les espèces d’intérêt aquacole : abord des effets neuroendocrines directs hypophysaires chez les téléostéens » (co-resp. Sylvie Dufour, EQ2 Paris et Karine Rousseau, EQ2 Paris / Participants : Pascal Favrel, EQ2 Caen et Pascal Sourdaine, EQ2 Caen et Dr Rebeca Martinez et Liz Hernadez, CIGB (Centro de Ingenieria Genetica y Biotechnologia de Cuba), la Havane, Cuba) : 2018. PDF
Type de programme | Intitulé complet | Période | |
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Yuschan Schoolar Program Taiwan | International | Evolutionary endocrinology of marine organisms | 2020 - 2023 |
PHC Finlay France-Cuba | International | Growth hormone secretagogues and fish neuro-immunoendocrinoogy for sustainable aquaculture and conservation | 2019 - 2020 |
HERITAGe | National/Régional | HERitabilité, épITranscriptome et Adaptation chez l’huître C. Gigas Effets de contaminants émergents, microplastiques et microalgues toxiques, sur le développement de l'huître via héritabilité épigénétique par méthylation de l'ARN | 2019 - 2020 |
DIM1Health | National/Régional | Anti-infectious and trans-species neuroendocrine effects of fish antimicrobial neuropeptides in rainbow trout, European eel using an in vitro genome editing platform | 2019 - 2020 |
UPSIDE | National/Régional | UV effects & pigments during Sepia officinalis development | 2019 - 2021 |
JSPS 2018 LIGHTOME, France-Japon | International | Comparative study of light perception in two cephalopod species: Sepia officinalis and Idiosepius paradoxus | 2018 |
MATO | National/Régional | Maturité objective des poissons par l'histologie quantitative - projet politique de site IFREMER | 2018 - 2019 |
ECUME | National/Régional | Etude Intégrée Multi-Echelles d’Ecosystèmes côtiers | 2018 - 2021 |
ATM LOCUS | National/Régional | Première LOcalisation ChromosomiqUe de gènes du déterminisme du Sexe chez les mollusques - approche comparative chez l’huître Crassostrea gigas et la seiche Sepia officinalis | 2017 - 2018 |
Salinité huitres | National/Régional | Salinité - Etude de la salinité de l’eau de stockage sur la composition biochimique et la texture de la chair des huîtres ainsi que sur leurs caractéristiques organoleptiques. Convention CRBN Actions en faveur du développement économique de la filière re | 2017 - 2019 |
OLICEB | International | OLICEB : OLfaction In CEphalopod Brain | 2016 |
DEVEOP (Picard+) | National/Régional | Extraocular photoreception in aquatic species and its developmental control: a comparison between amphioxus and cuttlefish | 2016 |
DEVO-LU puis LEDS | National/Régional | Rôle de la lumière sur le développement du système visuel des embryons et le comportement des juvéniles de Sepia officinalis | 2016 - 2017 |
Biligncell | National/Régional | Mise en place d'une lignée cellulaire de bivalve - Convention CRBN Actions en faveur du développement économique de la filière ressources marines | 2016 - 2019 |
DYNA | International | Dynamique de la neurogenèse chez la seiche Sepia officinalis | 2015 - 2016 |
DESYNCHRO | National/Régional | Changements globaux et désynchronisation du cycle de vie du saumon de Loire : mécanismes et enjeux pour la conservation | 2015 - 2016 |
BestClim | National/Régional | Buccin espèce sentinelle pour le climat - Convention CRBN 2015 PCM 22 Synergies Partenariale et Actions Novatrices | 2015 - 2016 |
ATM SEPIOM | National/Régional | Evolution de la coquille chez les Mollusques : approche descriptive des composés organiques impliqués dans la synthèse coquillière de la seiche, Sepia officinalis (Céphalopode) | 2015 - 2016 |
ITN IMPRESS | Européen | Improved production strategies for the conservation and management of endangered freshwater fish | 2015 - 2018 |
ANR NEMO | International | Neuropeptides of Marine organisms | 2015 - 2019 |
MANCHE 2012 | National/Régional | CPER MANCHE 2012 | 2015 - 2020 |
ATM PIGMENT | National/Régional | Quels pigments cache la seiche ? | 2014 |
ATM YEUX | National/Régional | Développement des yeux chez l’embryon de Seiche, Sepia officinalis et évolution des photorécepteurs | 2014 |
ATM CRISPR | National/Régional | Mise au point d’une technique d’invalidation de gène chez deux organismes aquatiques non-conventionnels, la seiche Sepia officinalis et l’huître Crassostrea gigas | 2014 - 2015 |
MADREPOP | National/Régional | Mécanismes de l'adaptation et de la résilience des populations exploitées | 2014 - 2015 |
REPRO-TEMP France-Espagne | International | The European Eel as a model to study the temperature a a modulator of the sexual maturation in teleots. Potential application in Aquaculture | 2014 - 2017 |
Global Networking Talent, MoST Taiwan | International | Taiwan-France Exchange Program | 2014 - 2017 |
Buloclim | National/Régional | Effets des changements climatiques sur le bulot. Convention CRBN 2013 PCM 14 Synergies Partenariale et Actions Novatrices | 2013 - 2014 |
TRIPLOIDES | National/Régional | Blocage de la reproduction des huitres triploïdes : mécanisme sous-jacent et impact de l’environnement – Convention CRBN 2013-PCM 04 Synergies Partenariale et Actions Novatrices | 2013 - 2015 |
NAISSAIN | National/Régional | Etude de l’état physiologique du naissain d’huître - Convention CRBN 2013-PCM 05 Synergies Partenariale et Actions Novatrices | 2013 - 2015 |
COST AQUAGAMETE | Européen | Assessing and improving the quality of aquatic animal gametes to enhance aquatic resources | 2013 - 2016 |
ANR SalTemp | National/Régional | Global warming and adaptation of migration in Atlantic salmon from long river Loire-Allier Axis | 2013 - 2017 |
PEPTISAN | National/Régional | Projet de développement de peptides thérapeutiques issus de la roussette (Scyliorhinus canicula), Région Basse-Normandie – FEDER 2890/33528 | 2012 - 2014 |
K4AQUA | National/Régional | Potentiel d’exploitation du peptide anti‐bactérien K4 dans les élevages aquacoles | 2012 - 2014 |
GIMEPEC | National/Régional | Génotoxicité immunotoxicité et repro-toxicité des pesticides chez C. gigas. ANR 11-CESA 0016 | 2012 - 2016 |
Alosa alosa | Européen | Conservation and restoration of the Allis shad in the Gironde and Rhine watersheds | 2011 - 2016 |
Eel genome project | International | International Consortium: The Eel genome project | 2010 |
ANR IMMORTEEL | International | IMpacts of Metallic and ORganic contaminations of the Gironde and St Laurent systems on two Threatened species, the European and American EELs | 2010 - 2014 |
PRO-EEL | Européen | Reproduction of European eel: towards a sustained aquaculture | 2010 - 2015 |
REPROSEED | Européen | REsearch to improve PROduction of SEED of established and emerging bivalve species in European hatcheries, FP7 245119 | 2009 - 2014 |