Les thématiques pour lesquelles nous avons développé une très large expertise portent sur l’étude du fonctionnement des écosystèmes aquatiques à travers l’utilisation combinée de marqueurs isotopiques, biochimiques et sclérochronologiques. Notre expertise est mise au service de questionnements clés : ceux de l’origine, du devenir et de la qualité de la matière organique pour une caractérisation optimale de l’état fonctionnel d’un écosystème aquatique.
Exemple de marqueur biochimique utilisé au laboratoire :
Les grandes thématiques du laboratoire sont abordées à travers deux approches principales :
1) les réponses des réseaux trophiques aux pressions anthropiques
2) les changements qualitatifs affectant les transferts à différentes échelles de la matière organique.
- "Scénariser l’impact des CHAngements climatiques sur les habitats de l’archipel de CHAusey (CHACHA)" - Resp. : Eric Goberville, Eq. SOMAQUA Paris ; autre participant BOREA : Frédéric Olivier, Eq. SOMAQUA Concarneau
- "Etude des poissons cavernicoles dans les Andes : taxonomie, caractérisation moléculaire de l'albinisme et barcoding (TRICHO)" - Resp. : Sébastien Baratte, Eq. EMERGE ; autres participants BOREA : Marc Pouilly et Najet Thiney, Eq. SOMAQUA Paris ; Clara Lord et Sophie Berland, Eq. BIOCAP
- "Vulnérabilité des écosystèmes littoraux tropicaux face à l'eutrophisation (VELITROP)" - Resp. : Gwenaël Abril, Eq. SOMAQUA Paris ; autre participant BOREA : Cédric Hubas, Eq. SOMAQUA Concarneau
- "Marqueurs biogéochimiques du fonctionnement des systèmes aquatiques amazoniens (BIOGEO-TAG)" - Resp. : Marc Pouilly, Eq. SOMAQUA Paris ; autre participant BOREA : Claire Lazareth, Eq. SOMAQUA Paris
| Type de programme | Intitulé complet | Période | |
|---|---|---|---|
| LONGFONG | National/Régional | Méta-barcoding des symbiotes fongiques : séquençage de reads longs (Nanopore) pour assembler les reads courts (Illumina) en OTUs réels | 2019 |
| MaMBo | National/Régional | Interactions entre Matière organique dissoute et particulaire et Microorganismes lors d’un Bloom de cyanobactéries | 2019 |
| VuBleu | International | Vulnérabilité du carbone bleu des mangroves face à l'eutrophisation | 2019 - 2020 |
| MICROBE | Européen | Microphytobenthos Biofilm structure and function under Environmental challenge | 2018 |
| IMPAIC | National/Régional | IMPacts Acoustiques sur les Invertébrés de la baie de Saint-BrieuC | 2018 - 2021 |
| BiEau-Amaz | International | BiEau-Amaz - Vers une approche biologique de la caractérisation géochimique des eaux amazoniennes à l’échelle infra-annuelle national (au niveau financier) et international | 2017 - 2018 |
| BIO-Tide | Européen | The role of microbial biodiversity in the functioning of marine tidal flat sediments | 2017 - 2020 |
| SaMbA | National/Régional | Synergie entre matière organique d’origine phytoplanctonique et communautés Microbiennes libres et Attachées | 2017 - 2020 |
| PRIVARC | International | PRIVARC Plasticité du recrutement des bivalves Arctiques | 2016 - 2017 |
| SCUBA | National/Régional | Structuration des CommUnautés Bactériennes de biofilms de récifs Artificiels | 2016 - 2017 |
| ENDOKELP | National/Régional | Mise en place d’un système expérimental in situ endophyte-kelp pour l’étude des interactions moléculaires impliquées dans la relation entre macroalgues et endomicrobiome | 2016 - 2018 |
| HULK | Européen | Les chloroplastes fonctionnels dans les cellules animales: élucider le puzzle | 2016 - 2019 |
| TRECH | National/Régional | Ecologie Trophique de l'espèce invasive et ingénieur Crepidula fornicata | 2016 - 2019 |
| Valorisation des données de l’expédition Madibenthos pour la gestion et la conservation | National/Régional | Valorisation des données de l’expédition Madibenthos pour la gestion et la conservation | 2016 - 2020 |
| LMI EDIA | International | Laboratoire Mixte International "Evolution et Domestication de l'Ichtyofaune Amazonienne" | 2016 - 2020 |
| MicroBE | National/Régional | Microfluidique des Biofilms Epilithiques : Impact de la chlordécone | 2015 |
| OBLT | International | Observatoire Binational du Lac Titicaca (OBLT) | 2015 - 2019 |
| Bioindication mangroves | National/Régional | Développement de l’indicateur DCE « Mangroves » | 2015 - 2021 |
| ISLAY | National/Régional | Caractérisation et rôle du métabolome fongique dans les InteractionS entre LAminaires et leurs champignons endophytes | 2014 - 2016 |
| PROCARDYA | National/Régional | Rôle et diversité des PROCARyotes planctoniques dans la DYnamique de dégradation de macro-Algues | 2013 - 2015 |
| PARAPETI | International | Bilan hydrologique, qualité biologique et gestion de l'eau dans la région du Chaco subandin | 2013 - 2016 |
| BBPolar_SCLERARCTIC | International | Bivalves pan-arctiques comme bioarchives polaires. | 2013 - 2016 |
| DRIVER | International | Déterminisme du Recrutement de bIValves sous contraintes Environnementales et anthRopiques | 2012 - 2016 |
| ANR CHLORINDIC | National/Régional | Contamination par la chlordecone du biofilm epilithique en rivière : recherche de bioindicateurs | 2012 - 2016 |
|
(2020) Modelling European small pelagic fish distribution: Methodological insights. Ecological Modelling 416:108902. doi: https://doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2019.108902 |
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