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Equipe 6 : SOurce et transfert de la Matière organique en milieu AQUAtique - SOMAQUA

 Ostréiculture
Biofilm

Thème général

Les thématiques pour lesquelles nous avons développé une très large expertise portent sur l’étude du fonctionnement des écosystèmes aquatiques à travers l’utilisation combinée de marqueurs isotopiques, biochimiques et sclérochronologiques. Notre expertise est mise au service de questionnements clés : ceux de l’origine, du devenir et de la qualité de la matière organique pour une caractérisation optimale de l’état fonctionnel d’un écosystème aquatique.

Exemple de marqueur biochimique utilisé au laboratoire :

Axes de recherche

Les grandes thématiques du laboratoire sont abordées à travers deux approches principales :

1) les réponses des réseaux trophiques aux pressions anthropiques

2) les changements qualitatifs affectant les  transferts à différentes échelles de la matière organique.

 

BOREA soutient les projets incitatifs collaboratifs "Coordination & Transversalité" suivants :

- "Scénariser l’impact des CHAngements climatiques sur les habitats de l’archipel de CHAusey (CHACHA)" - Resp. : Eric Goberville, Eq. SOMAQUA Paris ; autre participant BOREA : Frédéric Olivier, Eq. SOMAQUA Concarneau

- "Etude des poissons cavernicoles dans les Andes : taxonomie, caractérisation moléculaire de l'albinisme et barcoding (TRICHO)" - Resp. : Sébastien Baratte, Eq. EMERGE ; autres participants BOREA : Marc Pouilly et Najet Thiney, Eq. SOMAQUA Paris ; Clara Lord et Sophie Berland, Eq. BIOCAP

BOREA soutient les projets incitatifs collaboratifs "Sud" suivants :

- "Vulnérabilité des écosystèmes littoraux tropicaux face à l'eutrophisation (VELITROP)" - Resp. : Gwenaël Abril, Eq. SOMAQUA Paris ; autre participant BOREA : Cédric Hubas, Eq. SOMAQUA Concarneau

- "Marqueurs biogéochimiques du fonctionnement des systèmes aquatiques amazoniens (BIOGEO-TAG)" - Resp. : Marc Pouilly, Eq. SOMAQUA Paris ; autre participant BOREA : Claire Lazareth, Eq. SOMAQUA Paris

Programmes de recherche

Type de programme Intitulé complet Période
MaMBo National/Régional Interactions entre Matière organique dissoute et particulaire et Microorganismes lors d’un Bloom de cyanobactéries 2019
LONGFONG National/Régional Méta-barcoding des symbiotes fongiques : séquençage de reads longs (Nanopore) pour assembler les reads courts (Illumina) en OTUs réels 2019
VuBleu International Vulnérabilité du carbone bleu des mangroves face à l'eutrophisation 2019 - 2020
MICROBE Européen Microphytobenthos Biofilm structure and function under Environmental challenge 2018
IMPAIC National/Régional IMPacts Acoustiques sur les Invertébrés de la baie de Saint-BrieuC 2018 - 2021
BiEau-Amaz International BiEau-Amaz - Vers une approche biologique de la caractérisation géochimique des eaux amazoniennes à l’échelle infra-annuelle national (au niveau financier) et international 2017 - 2018
BIO-Tide Européen The role of microbial biodiversity in the functioning of marine tidal flat sediments 2017 - 2020
SaMbA National/Régional Synergie entre matière organique d’origine phytoplanctonique et communautés Microbiennes libres et Attachées 2017 - 2020
PRIVARC International PRIVARC Plasticité du recrutement des bivalves Arctiques 2016 - 2017
SCUBA National/Régional Structuration des CommUnautés Bactériennes de biofilms de récifs Artificiels 2016 - 2017
ENDOKELP National/Régional Mise en place d’un système expérimental in situ endophyte-kelp pour l’étude des interactions moléculaires impliquées dans la relation entre macroalgues et endomicrobiome 2016 - 2018
HULK Européen Les chloroplastes fonctionnels dans les cellules animales: élucider le puzzle 2016 - 2019
TRECH National/Régional Ecologie Trophique de l'espèce invasive et ingénieur Crepidula fornicata 2016 - 2019
LMI EDIA International Laboratoire Mixte International "Evolution et Domestication de l'Ichtyofaune Amazonienne" 2016 - 2020
Valorisation des données de l’expédition Madibenthos pour la gestion et la conservation National/Régional Valorisation des données de l’expédition Madibenthos pour la gestion et la conservation 2016 - 2020
MicroBE National/Régional Microfluidique des Biofilms Epilithiques : Impact de la chlordécone 2015
OBLT International Observatoire Binational du Lac Titicaca (OBLT) 2015 - 2019
Bioindication mangroves National/Régional Développement de l’indicateur DCE « Mangroves » 2015 - 2021
ISLAY National/Régional Caractérisation et rôle du métabolome fongique dans les InteractionS entre LAminaires et leurs champignons endophytes 2014 - 2016
PROCARDYA National/Régional Rôle et diversité des PROCARyotes planctoniques dans la DYnamique de dégradation de macro-Algues 2013 - 2015
BBPolar_SCLERARCTIC International Bivalves pan-arctiques comme bioarchives polaires. 2013 - 2016
PARAPETI International Bilan hydrologique, qualité biologique et gestion de l'eau dans la région du Chaco subandin 2013 - 2016
ANR CHLORINDIC National/Régional Contamination par la chlordecone du biofilm epilithique en rivière : recherche de bioindicateurs 2012 - 2016
DRIVER International Déterminisme du Recrutement de bIValves sous contraintes Environnementales et anthRopiques 2012 - 2016
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Articles scientifiques

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Moteur de recherche Bibliographie

2018
Riera E, Lamy D, Goulard C, et al. (2018) Biofilm monitoring as a tool to assess the efficiency of artificial reefs as substrates: Toward 3D printed reefs. Ecological Engineering 120:230 - 237. doi: https://doi.org/10.1016/j.ecoleng.2018.06.005
PDF icon 2018.Riera et al.pdf (597.83 Ko)
PDF icon fmicb-09-03161.pdf (2.4 Mo)
2017
Dirberg G (2017) Stratégie de développement des outils de bio-indication en mangroves pour la DCE. Convention ONEMA/MNHN 2016 Document élaboré dans le cadre de la Solidarité avec l’Outre-mer 25 pp.
PDF icon stratégie bioindication mangrove DCE _vfinale20170217.pdf (363.87 Ko)
Erler DV, Welsh DT, Bennet WW, et al. (2017) The impact of suspended oyster farming on nitrogen cycling and nitrous oxide production in a sub-tropical Australian estuary. Estuarine, Coastal and Shelf Science 192:117 - 127. doi: http://dx.doi.org/10.1016/j.ecss.2017.05.007
PDF icon 1-s2.0-S0272771417301592-main.pdf (1.18 Mo)

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