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Equipe 7 : Biodiversité, macroécologie et aquaculture

Goujon Asiatique Pseudorasbora parva, invasif et vecteur d’un champignon pathogène.
Echantillonnage en grand milieu

Thème général

Au sein de l’équipe 7,  les recherches se focalisent sur les communautés  aquatiques d’eau douce, leur dynamique naturelle et sous l’action du changement global (axe macro-écologie et changement global) ainsi que l’effet en retour de la biodiversité aquatique vers les populations humaines (ressources biologiques, maladies émergentes) (axe services de la biodiversité).

Axes de recherche

Macro-écologie et changement global.

Dans cet axe sont analysées les conséquences du changement global (changement climatique, introductions biologiques, modification et dégradation de l’habitat, exploitation des ressources) sur la dynamique des communautés aquatiques en privilégiant une approche macro-écologique. Cette démarche non-expérimentale et comparative utilise largement  les « expériences naturelles » pour identifier les facteurs de structuration des communautés en combinant les apports de l’écologie, de la biogéographie, de la paléontologie et de la phylogénétique et orienter des approches plus expérimentales ou plus locales.

Services de la biodiversité.

Dans cet axe on s’intéresse aux  liens existant entre biodiversité des eaux douces et  populations humaines au travers de l’usage de ressources biologiques et de l’émergence de maladies.  Un premier objectif est de fournir les outils scientifiques pour développer  une aquaculture respectueuse de l’environnement pour des espèces d’intérêt commercial afin de limiter les pressions humaines sur leurs populations naturelles.  Les recherches se focalisent sur le bassin amazonien en collaboration avec  des équipes péruviennes et boliviennes. Un deuxième objectif est l’étude de la contribution des habitats aquatiques, leur biodiversité et leur utilisation par l’homme à l’émergence ou le maintien de maladies humaines.  En collaboration avec l’UMR MIVEGEC (Montpellier) Les recherches se focalisent sur l’ulcère de Buruli, une maladie tropicale possiblement transmise par des insectes aquatiques.

Programmes de recherche

Type de programme Intitulé complet Période
SATMAR 3 National/Régional Développement de nouveaux outils de gestion sanitaire en écloserie de mollusques 2018 - 2019
SATMAR 2 National/Régional Recherche de souches anti-vibrioses 2017 - 2018
TDSB Tropical Deep Sea Benthos National/Régional Valoriser les collections d'histoire naturelle et les expéditions naturalistes pour la conservation et la gestion des milieux profonds. Le cas unique du programme Tropical Deep-Sea Benthos 2017 - 2019
ODYSSEUS Européen Between Scylla and Charybdis – managing connectivity for freshwater fish 2017 - 2019
HEDGE LEDGE National/Régional Etude de nouveaux indicateurs internationaux de biodiversité basés sur l’originalité phylogénétique et la probabilité d’extinction des espèces : identification des espèces HEDGE et LEDGE 2017 - 2019
REPCCOAI International Réponse de l’Ecosystème Pélagique aux Changements Climatiques dans l’Océan Indien Austral 2017 - 2020
LARVAplus International LARVAplus « Stratégies de développement et amélioration de la production de larves de poissons en Ibéro-Amérique » 2017 - 2020
LARVAMAZ International Biodiversité et écologie amazoniennes : apport du métabarcoding appliqué aux larves de poissons 2016 - 2017
ANR TROPHIK National/Régional Approche écosystémique des EMR – Modélisation du rôle des éoliennes offshore dans la modification du fonctionnement des réseaux trophiques côtiers et dans le cumul d’impacts 2016 - 2018
AMAZONFISH International Amazonian fishes and climate change - AMAZONFISH 2016 - 2018
PEPTRAQ National/Régional PEPTRAQ, un nouvel outil de recherche ciblé pour les bases de données “omiques” 2016 - 2019
LMI EDIA International Laboratoire Mixte International "Evolution et Domestication de l'Ichtyofaune Amazonienne" 2016 - 2020
FINCyt Pérou International Projet FINCyt au Pérou 2015 - 2017
Application de marqueurs moléculaires pour la caractérisation des poissons amazonien d’intérêt commercial (pour la consommation humaine ou l’aquariophilie) et leur application dans le suivi des exportations, du commerce et de la gestion International Application de marqueurs moléculaires pour la caractérisation des poissons amazonien d’intérêt commercial (pour la consommation humaine ou l’aquariophilie) et leur application dans le suivi des exportations, du commerce et de la gestion 2015 - 2017
MANCHE 2012 National/Régional CPER MANCHE 2012 2015 - 2020
FRESH National/Régional Mega measure of freshwater biodiversity: Implications in our understanding of infectious disease emergence 2014
MINAM International Systématique et organisation populationnelle d'Arapaima gigas en Amazonie péruvienne 2014 - 2015
FINCyt International Comportement reproducteur d'Arapaima gigas en milieu expérimental, gestion des alevins et nutrition 2014 - 2016
BIOHOPSYS National/Régional Biodiversité et dynamique des interactions dans des systèmes multi-hôtes-parasites 2014 - 2017
DIADEMA National/Régional DIssecting Amazonian Diversity by Enhancing a Multiple taxa Approach 2014 - 2017
PROBIS Européen Heterogeneity of patterns and processes along biological invasion successions 2014 - 2017
Shading light on the migration patterns of Brachyplatystoma species in the Madeira/Solimões basins using otolith 87SR/86Sr ratios International Shading light on the migration patterns of Brachyplatystoma species in the Madeira/Solimões basins using otolith 87SR/86Sr ratios 2014 - 2017
GENESIS National/Régional Le rôle de la diversité génétique et de la plasticité phénotypique dans l’adaptation aux changements environnementaux: une approche génomique de l’invasion biologique. 2014 - 2018
PetFood 3 National/Régional Développement d'hydrolysats destinés à la formulation d'aliments pour l'aquaculture : normalisation structurale et optimisation fonctionnelle 2014 - 2018
SATMAR 1 National/Régional Contrat anti-vibriose 2014 - 2018
ACTISEP National/Régional Identification de peptides antimicrobiens à utilisation aquacole 2013 - 2015
IRBAS National/Régional Analyse et Synthèse de la Biodiversité des Rivières Intermittentes 2013 - 2015
PetFood 1 National/Régional Analyse peptidomique d'un hydrolysat protéique destiné à la formulation d'un granulé piscicole 2012
PetFood 2 National/Régional Caractérisation moléculaire et performances in vivo de deux hydrolysats de co-produits 2012 - 2014
Exporter sous Excel

Articles scientifiques

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Moteur de recherche Bibliographie

1999
PDF icon Spawning season variations of female Nile tilapia, Oreochromis niloticus, populations from man-made lakes of Côte d'Ivoire.pdf (223 Ko)
1998
PDF icon Evidence of environmental effects on reproductive characteristics of Nile tilapia populations from man made lakes of Ivory Coast.pdf (686.74 Ko)
PDF icon Variations in age and size at maturity of female Nile tilapia, Oreochromis niloticus, populations from man-made lakes of Côte d'Ivoire.pdf (860 Ko)
1997
PDF icon Plasma Vitellogenin Levels during the Annual Reproductive Cycle of the Female Rainbow Trout ( Oncorhynchus mykiss )- Establishment and Validation of an ELISA_compr2.pdf (608.21 Ko)

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