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Programmes de recherche nationaux et régionaux

Equipe 5 : Diversité et Interactions dans les Ecosystèmes Côtiers

Equipe 6 : Source et Transfert de la Matière Organique en Milieu Aquatique

MaMBo

2019

Les micro-organismes (bactéries et archées) jouent un rôle essentiel dans la transformation et le devenir de la matière organique (MO) des réseaux trophiques aquatiques. En retour, la MO structure et conditionne les communautés microbiennes, selon son origine, sa qualité et sa quantité. Ainsi, structure de la MO et structure des communautés microbiennes fonctionnent en potentielle synergie. Cependant, les liens existant entre les caractéristiques biochimiques de cette MO et l’activité des microorganismes associés et qui l’exploitent restent encore peu explorés.

SaMbA

2017 - 2020

De par leur grande diversité métabolique, les microorganismes (bactéries et archées) constituent un maillon fondamental dans le transfert de la matière organique (MO) aquatique au sein des réseaux trophiques planctoniques et conditionnent en partie son transfert vers le compartiment benthique. En effet, les activités des microorganismes hétérotrophes, soutenues et potentiellement coordonnées par l’existence de mécanismes de communication cellulaire (ou quorum-sensing, e.g. Hmelo et al. 2011, Jatt et al. 2015), permettent la minéralisation de la MO et ainsi régulent ses flux.

SCUBA

2016 - 2017

La colonisation des récifs artificiels commence par celle du microfouling ou biofilm, correspondant à l’établissement de colonies pionnières de microorganismes. Ces microorganismes vont sécréter une matrice de polymères extracellulaires (EPS) constitutifs du biofilm, matrice sur laquelle vont s’installer des macroorganismes sessiles, à leur tour déterminants dans l’établissement des maillons trophiques supérieurs du réseau trophique du récif. Ainsi, l’établissement des communautés microbiennes est essentiel pour le bon fonctionnement de l’écosystème récifal.

MicroBE

2015

L’objectif principal de ce projet est de mettre en évidence les effets de la chlordéconne (CLD) sur les propriétés physiques du biofilm dans un contexte hydrodynamique contrôlé. Notre hypothèse est que l’accumulation du pesticide par la communauté dépend des propriétés physiques du biofilm qui sont elles-­mêmes conditionnées par les conditions hydrodynamiques auxquelles le biofilm est exposé. Nous pensons également que la CLD peut altérer les propriétés physiques du biofilm et induire ainsi un mécanisme coopératif de capture du composé.

PROCARDYA

Microcosmes utilisés lors de l’expérience de dégradation du projet PROCARDYA.
2013 - 2015

Les procaryotes planctoniques constituent un maillon fondamental dans le transfert de la matière organique (MO) océanique au sein des réseaux trophiques planctoniques et conditionne en partie son transfert vers le domaine benthique. En retour, la structuration des communautés procaryotiques semble être directement liée à la nature et la biodisponibilité de la MO, dès lors qu’il a été montré que différents phylotypes de procaryotes seraient impliqués spécifiquement dans la dégradation de certains composés organiques, de qualité et d’origine différentes.

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