Le projet proposé s’inscrit dans le cadre des travaux de BIOPAC qui visent à clarifier le statut de l’ichtyofaune insulaire dulçaquicole de la région Indo-Pacifique à travers la révision taxonomique des espèces et la création d’une base de références moléculaires (pour le barcode et l’ADNe) via la base de données internationale BOLD System accessible en ligne. Ces travaux serviront de base pour la mise à jour des référentiels taxonomiques et moléculaires des Départements et Régions d’Outre-Mer Français (DROM), en particulier de La Réunion et de Mayotte.

Le projet vise à débuter une Bibliothèque de Référence Moléculaire des Poissons de Bolivie associée à une collection de spécimens conservés au Museum National d’Histoire Naturelle de La Paz, Bolivie sur la base d’échantillons collectés par WCS Bolivie.
Les objectifs :
- Former les responsables de collection (MNHN Bolivie) aux protocoles pour associer les spécimens et leur référence moléculaire (depuis l’échantillonnage terrain jusqu’à la conservation des échantillons et les bases de données (Nicolas Rabet, Gaël Denis)

Le projet REGAL 2 2024 s’inscrit dans la poursuite du projet REGAL 2023 et s’appuie sur une collaboration avec l’équipe FAREHA de l’Ecole Supérieure d’Agronomie (ESA) de Yamoussoukro. L’objectif principal de cette collaboration est de contribuer au développement d’une pisciculture durable de l’espèce Heterotis niloticus en levant les verrous techniques actuels au niveau de l’alimentation et de la reproduction.

Sacculina carcini est un endoparasite du crabe vert, Carcinus maenas. Ce parasite induit des changements comportementaux chez son hôte et affecte son métabolisme en inhibant la mue et la reproduction. En utilisant une approche protéomique par spectrométrie de masse, nous avons étudié les protéomes de l'hémolymphe de crabes verts sauvages sains et parasités de Bretagne (France) afin d'identifier les protéines qui sont exprimées de manière différentielle due à la présence du parasite.

Le projet ddB-ADNe vise à développer l’expertise de la technique d’ADN environnemental par digital droplet PCR (ddPCR) au sein du laboratoire BOREA. La ddPCR, étant une approche monospécifique, permet non seulement de détecter sans séquençage la présence d’une espèce dans le milieu, mais aussi, de quantifier la quantité de son ADN filtré.

Pour l’axe transversal MIgration, DIspersion des organismes aquatiques (MIDI), nous proposons de continuer le projet collaboratif à l’échelle de l’UMR en renouvelant un séquençage collectif mais avec des nouveautés significatives. Après deux années de réalisation nous avons pu dresser un bilan avec l’ensemble des participants et cerner des améliorations. La nouvelle stratégie devrait permettre de résoudre les problèmes observés qui sont liés au prestataire de séquençage (production de chimères par l’ICM).