Romain Causse, soutiendra sa thèse de doctorat, intitulée :

Le genre Stenogobius (Teleostei : Gobioidei) dans l’Indo-Pacifique : révision taxonomique, histoire de vie et évolution

• Sylvie Dufour (CNRS) : examinatrice
• Fabienne Audebert (Sorbonne Université) : examinatrice
• Daniela Banaru (Université Aix-Marseille) : examinatrice
• Tatiana Colchen (Université d'Angers) : examinatrice
• Paulo Brito (Université de Rio de Janeiro) : rapporteur
• Fabrice Télétchéa (Université Nancy Lorraine) : rapporteur
• Philippe Keith (MNHN) : directeur de thèse
• Clara Lord (Sorbonne Université) : directrice de thèse
• Marion Mennesson (IRCGN) : membre invité

Résumé de thèse

Les rivières insulaires tropicales de l’Indo-Pacifique abritent une biodiversité aquatique unique et fragile, largement dominée par des espèces dulçaquicoles amphidromes, vivant en rivière et dont la phase larvaire est marine permettant la dispersion et la colonisation. Ces systèmes, historiquement vierges de toute faune d’eau douce, ont été colonisés principalement par les Gobiiformes, dont le genre Stenogobius. Cette thèse propose une analyse intégrative (morphologie, génétique, otolithométrie) du genre Stenogobius à l’échelle de la région Indo-Pacifique. Le premier volet porte sur une révision taxonomique des espèces présentes dans ces milieux isolés et fragmentés, révélant la présence d’une espèce à très large répartition (Stenogobius genivittatus), ainsi que la co existence d’espèces endémiques au niveau de la frontière Indo-Pacifique. Le second volet examine les traits de vie liés à l’amphidromie, notamment la durée de la phase larvaire marine, mesurée par sclérochronologie des otolithes pour S. genivittatus. Enfin, l’analyse phylogéographique basée sur des marqueurs moléculaires permet d’identifier la structuration génétique spatiale des populations et de mieux comprendre les routes de dispersion larvaire à travers cette région et les effets des barrières physiques présentes ou passées. L’ensemble des résultats souligne le rôle central des cycles amphidromes dans la colonisation et la connectivité des faunes dulçaquicoles insulaires, tout en mettant en lumière la vulnérabilité de ces espèces face aux pressions anthropiques (déforestation, pollution, barrages, introductions). Des recommandations de conservation sont proposées afin de préserver les habitats essentiels à ces poissons, en tenant compte des particularités écologiques, évolutives et biogéographiques de la région.

Abstract

Tropical insular rivers of the Indo-Pacific host a unique and fragile aquatic biodiversity mainly represented by amphidromous freshwater species; they live in rivers but undergo a marine larval phase, important in terms of dispersal and colonisation of these fragmented habitats. These ecosystems, originally devoid of any freshwater fauna, have mostly been colonised by Gobiiformes, including the genus Stenogobius. This thesis presents an integrative analysis (morphology, genetics, otolithometry) of Stenogobius across the Indo-Pacific region. The first component focuses on a taxonomic revision the genus, revealing the presence of a widely distributed species, Stenogobius genivittatus, found from South Africa to Hawaii four endemic species at the Indo-Pacific barrier and 15 previously valid species were placed in synonymy. The second component examines life history traits related to amphidromy, in particular the duration of the pelagic larval phase, estimated by otolith microstructural analysis for S. genivittatus. Finally, the population structure of S. genivittatus was investigated to discuss the dispersal capacity of the species and the impact of past and present barriers on the species’ distribution. The results presented highlight the central role of amphidromous life cycles in the colonization processes and in the maintenance of the connectivity between populations. However, these species are highly vulnerable to anthropogenic pressures and the conservation status of these species, if any, are Least Concern or Data Deficient. This work improves greatly the knowledge on the Stenogobius genus, with a revised taxonomy, which is compulsory for the implementation of future conservation and/or management measures.