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- Louis BENOIST
Louis BENOIST
Sujet de la thèse :
Etude du système immunitaire et du microbiome associé à la peau chez la seiche Sepia officinalis : un potentiel pour l'aquaculture et le domaine maritim
Résumé :
Les Céphalopodes, comme la seiche Sepia officinalis, sont présents dans les océans depuis des millions d’années. Chez ces animaux, seule l’immunité innée protège l’organisme des agressions via une réponse cellulaire et une réponse humorale. Peu de pathologies sont observées, suggérant la présence d’un système immunitaire efficace. Toutefois ce système reste encore peu étudié chez les Céphalopodes. Si les molécules de reconnaissance et les voies de signalisation ont été décrites, les effecteurs restent inconnus. La présence de molécules antibactériennes ou antioxydantes associées à l’encre, aux œufs, aux coproduits de la peau ou à certaines bactéries symbiotiques ont été révélées mais peu ont été identifiées. Ainsi, le premier objectif de la thèse est de caractériser le système immunitaire de la seiche et d’identifier les effecteurs humoraux en étudiant particulièrement le corps blanc, organe hématopoïétique ainsi que la peau, via des approches en transcriptomique, peptidomique et de protéomique. Chez les organismes aquatiques, la peau est recouverte d’un mucus abritant un microbiome, la protection de l’organisme est également assurée par ce biofilm.
Le second objectif est d’explorer la biodiversité du microbiome associé à la peau chez la seiche, de sa mise en place chez des stades précoces à sa dégénérescence chez des animaux en fin de vie via une approche métagénomique.
Enfin, l’objectif final de cette thèse est d’explorer le potentiel de ces nouveaux antimicrobiens d’origine animale ou d’origine bactérienne en aquaculture ainsi que sur des problématiques de biofouling et de biocorrosion.
My Papers
2020
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Benoist, Louis , Erwan Corre, Benoît Bernay, Joël Henry, and Céline Zatylny-Gaudin. 2020. “-Omic Analysis Of The Sepia Officinalis White Body: New Insights Into Multifunctionality And Haematopoiesis Regulation”. Journal Of Proteome Research 19 (8): 3072 - 3087. doi:10.1021/acs.jproteome.0c0010010.1021/acs.jproteome.0c00100.s00110.1021/acs.jproteome.0c00100.s002. https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.0c00100.
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Benoist, Louis , Baptiste Houyvet, Joël Henry, Erwan Corre, Bruno Zanuttini, and Céline Zatylny-Gaudin. 2020. “In-Depth In Silico Search For Cuttlefish Antimicrobial Peptides Following Bacterial Challenge Of Haemocytes”. Marine Drugs 18 (9): 439. doi:10.3390/md18090439. https://www.mdpi.com/1660-3397/18/9/439.
marinedrugs-18-00439.pdf (2.05 MB)
2018
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Endress, Maxime , Céline Zatylny-Gaudin, Erwan Corre, Gildas Le Corguillé, Louis Benoist, Jérôme Leprince, Benjamin Lefranc, et al.. 2018. “Crustacean Cardioactive Peptides: Expression, Localization, Structure, And A Possible Involvement In Regulation Of Egg-Laying In The Cuttlefish Sepia Officinalis.”. Gen. Comp. Endocrinol. 1 (260): 67-79. doi:10.1016/j.ygcen.2017.12.009.