- Membres
- Pascal Jean LOPEZ
Pascal Jean LOPEZ
Les composés organiques impliqués dans les minéralisations de type carbonaté seraient impliqués dans le contrôle des conditions physicochimiques locales, la nucléation et l’extension. La croissance resterait directionnelle mais libre. En revanche, même si l’on retrouve des structures carbonatées amorphes stables chez certains organismes minéralisant (comme chez les crustacés), le contrôle fin (aux petites échelles) de la forme tridimensionnelle d’un biomatériel de composition amorphe (désordre structural) semble plus délicat. Dans ce contexte, l’étude de la minéralisation et de la structuration de la silice reste une question importante sur laquelle on travaille depuis plusieurs années. Ainsi, même si l’on rencontre des accumulations ou des minéralisations de la silice dans un grand nombre d’organismes aquatiques (certains Gastropodes : limpets et chitons), éponges, radiolaires, haptophytes, brachiopodes, nos connaissances sur ce mécanisme de biominéralisation de la silice viennent surtout de l’étude des diatomées.
Les diatomées (hétérokontes) sont des microalgues unicellulaires responsables de près de 20 % de la production primaire nette sur la Terre. Ces dernières années des connaissances importantes ont été acquises sur ces organismes grâce aux développements de la génomique (génomes, EST, petits ARNs) mais aussi à la mise en place d’outils d’études fonctionnelles. Ainsi, certains composés organiques directement impliqués dans la formation du thèque, appelé frustule, et dans le transport de l’acide silicique ont été identifiés chez plusieurs espèces. Pour mieux comprendre la formation du frustule nous réaliserons des couplages entre études physiologiques (croissance métabolisme du silicium, des carbohydrates et de l’homéostasie de pH), morphométriques, dynamiques à des études génomiques. En particulier, nous étudierons l’un des taxons les plus anciens et les plus larges chez les diatomées : celui des Thalassiosirales.
Chez ces microalgues, nos études ont révélé l’importance du pH environnemental sur l’homéostasie de pH intracellulaire, la morphologie du thèque et sa dynamique de formation. Aujourd’hui, nous souhaitons poursuivre ces études de l’impact de facteurs environnementaux (essentiellement pH, salinité) en étudiant prioritairement la réponse à court terme et à long terme d’espèces clés. L’étude comparative interspécifique nous donnera des informations nouvelles sur la robustesse du processus de formation du thèque et sur la plasticité phénotypique au sein de populations/d’espèces différentes.
Nous espérons ainsi contribuer à une meilleure compréhension de la sensibilité des diatomées en fonction de leur répartition géographique. Les analyses comparatives apporteront non seulement des informations quantitatives sur les gènes impliqués dans le processus de minéralisation de la silice chez les diatomées mais aussi des informations qualitatives quant aux différences génomiques et physiologiques entre espèces provenant d’écotypes distincts.
- Master UPMC-MNHN. UE “Biominéralisations” – SEP 53. (2013-2014)
- Master du Muséum National d’Histoire Naturelle. SEP 50: “Powerful Analytical Techniques in the Study of Biominerals”. (2009)
- Master de Chimie de l’Ecole Normale Supérieure. UE BIO1 : “Biologie moléculaire de la cellule”. (2006-2008)
- Responsable de l’Equipe 1 « Evolution des Biominéralisations et adaptation aux Contraintes Environnementales ».
- Secrétaire Scientifique de la Commission Interdisciplinaire 52 du CNRS “Environnements sociétés : du fondamental à l'opérationnel” (http://www.cnrs.fr/comitenational/cid/cid52.htm). (depuis 2013)
- Représentant du MNHN auprès l’Alliance nationale de recherche pour l’Environnement (AllEnvi). Groupe de travail 8 – Relation Climat/Océan et grands cycles. (http://www.allenvi.fr/thematiques/mer/questions-de-recherche) (depuis 2012)
- Membre du Conseil Scientifique et membre du LABEX CORAIL. Partenaires : INEE-CNRS, UR, UNC, UPF, UAG, IFREMER, IRD, EPHE. (http://www.labex-corail.fr). (depuis 2011)
- Membre du LABEX BCDIV, “Diversités biologiques et culturelles : origines, évolution, interactions, devenir”. Partenaires : CNRS, MNHN, IRD, EPHE. (http://www.labex-bcdiv.mnhn.fr/) (depuis 2014)
- Membre du Conseil Scientifique de la Société Française de Biologie des Tissus Minéralisés (http://sfbtm.univ-littoral.fr/). (depuis 2014)
- Membre du Réseau Francilien sur les Oxydes Fonctionnels (http://www.dim-oxymore.fr/). (depuis 2011)
- Membre du Réseau C’Nano Ile-de-France, Actions transverses : Nanosciences et Société (http://www.cnanoidf.org/-Home-). (2009-2012)
My Papers
2025
-
Hervé, Vincent , Jérôme Morelle, Josie Lambourdière, Pascal Jean Lopez, and Pascal Claquin. 2025. “Together Throughout The Year: Seasonal Patterns Of Bacterial And Eukaryotic Microbial Communities In A Macrotidal Estuary”. Environmental Microbiome 20 (1). doi:10.1186/s40793-025-00664-y. https://environmentalmicrobiome.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40793-025-00664-y.s40793-025-00664-y.pdf (2.03 MB)
2024
-
Duthoo, Emilie , Jérôme Delroisse, Barbara Maldonado, Fabien Sinot, Cyril Mascolo, Ruddy Wattiez, Pascal Jean Lopez, Cécile Van de Weerdt, Matthew J Harrington, and Patrick Flammang. 2024. “Diversity And Evolution Of Tyrosinase Enzymes Involved In The Adhesive Systems Of Mussels And Tubeworms”. Iscience 27 (12): 111443. doi:10.1016/j.isci.2024.111443. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004224026701.1-s2.0-S2589004224026701-main.pdf (5.11 MB)
-
Le Berre, Iwan , Eric Foulquier, Damien Le Guyader, Clément Iphar, Manuel Sahuquet, and Pascal Jean Lopez. 2024. “De L’emprise À L’empreinte : Cartographier La Donnée Ais Pour Qualifier L’occupation De L’espace Maritime Caribéen”. Cybergeo. doi:10.4000/cybergeo10.4000/cybergeo.4080010.4000/123ic. https://journals.openedition.org/cybergeohttps://journals.openedition.org/cybergeo/40800https://journals.openedition.org/cybergeo/41168.cybergeo-41168.pdf (4.17 MB)
-
Haderlé, Rachel , Laurent Bouveret, Jordane Chazal, Justine Girardet, Samuel Iglésias, Pascal Jean Lopez, Cédric Millon, et al.. 2024. “Edna-Based Survey Of The Marine Vertebrate Biodiversity Off The West Coast Of Guadeloupe (French West Indies)”. Biodiversity Data Journal 12. doi:10.3897/BDJ.12.e125348. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38948133/.
-
Denoeud, France , Olivier Godfroy, Corinne Cruaud, Svenja Heesch, Zofia Nehr, Nachida Tadrent, Arnaud Couloux, et al. 2024. “Evolutionary Genomics Of The Emergence Of Brown Algae As Key Components Of Coastal Ecosystems”. Cell 187 (24): 6943 - 6965.e39. doi:10.1016/j.cell.2024.10.049. https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01272-8.1-s2.0-S0092867424012728-main.pdf (36.74 MB)
2023
-
Hervé, Vincent , Pierre Sabatier, Josie Lambourdière, Richard Raymond, Eric Foulquier, Iwan Le Berre, and Pascal Jean Lopez. 2023. “Pesticide Upsurge, Cross-Contamination And Biodiversity: Case Studies From The Caribbean Coast Human-Environment Observatory”. Comptes Rendus. Géoscience 356 (S3): 1 - 22. doi:10.5802/crgeos.236. https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/geoscience/articles/10.5802/crgeos.236/https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/geoscience/item/10.5802/crgeos.236.pdf.CRGEOS_2024__356_S3_A4_0.pdf (3.32 MB)
-
Hervé, Vincent , Pierre Sabatier, Josie Lambourdière, Jérôme Poulenard, and Pascal Jean Lopez. 2023. “Temporal Pesticide Dynamics Alter Specific Eukaryotic Taxa In A Coastal Transition Zone”. Science Of The Total Environment 866: 161205. doi:10.1016/j.scitotenv.2022.161205. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969722083097.
-
Rapinski, Michael , Richard Raymond, Damien Davy, Thora Herrmann, Jean-Philippe Bedell, Abdou Ka, Guillaume Odonne, et al. 2023. “Local Food Systems Under Global Influence: The Case Of Food, Health And Environment In Five Socio-Ecosystems”. Sustainability 15 (3): 2376. doi:10.3390/su15032376. https://www.mdpi.com/2071-1050/15/3/2376.
2022
-
Madon, Bénédicte , Damien Le Guyader, Jean-Luc Jung, Benjamin de Montgolfier, Pascal Jean Lopez, Eric Foulquier, Laurent Bouveret, and Iwan Le Berre. 2022. “Pairing Ais Data And Underwater Topography To Assess Maritime Traffic Pressures On Cetaceans: Case Study In The Guadeloupean Waters Of The Agoa Sanctuary”. Marine Policy 143: 105160. doi:10.1016/j.marpol.2022.105160. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0308597X2200207X.
-
Devault, Damien A, Félix Massat, Alexandre Baylet, Franck Dolique, and Pascal Jean Lopez. 2022. “Arsenic And Chlordecone Contamination And Decontamination Toxicokinetics In Sargassum Sp.”. Environmental Science And Pollution Research 29 (1): 6 - 16. doi:10.1007/s11356-020-12127-7. https://link.springer.com/10.1007/s11356-020-12127-7.
2021
-
Claquin, Pascal , Malika René-Trouillefou, Pascal Jean Lopez, Aurélien Japaud, Yolande Bouchon-Navaro, Sébastien Cordonnier, and Claude Bouchon. 2021. “Singular Physiological Behavior Of The Scleractinian Coral Porites Astreoides In The Dark Phase”. Coral Reefs doi.org/10.1007/s00338-020-02023-4 (40): 139-150. https://link.springer.com/article/10.1007/s00338-020-02023-4.
-
Hervé, Vincent , Josie Lambourdière, Malika René-Trouillefou, Damien Alain Devault, and Pascal Jean Lopez. 2021. “Sargassum Differentially Shapes The Microbiota Composition And Diversity At Coastal Tide Sites And Inland Storage Sites On Caribbean Islands”. Front Microbiol 12: 701155. doi:10.3389/fmicb.2021.701155.
-
Coché, Lorraine , Elie Arnaud, Laurent Bouveret, Romain David, Eric Foulquier, Nadège Gandilhon, Etienne Jeannesson, et al.. 2021. “Kakila Database: Towards A Fair Community Approved Database Of Cetacean Presence In The Waters Of The Guadeloupe Archipelago Based On Citizen Science”. Biodiversity Data Journal 9. doi:10.3897/BDJ.9.e69022. https://bdj.pensoft.net/article/69022/.
-
Coché, Lorraine , Elie Arnaud, Laurent Bouveret, Romain David, Eric Foulquier, Nadège Gandilhon, Etienne Jeannesson, et al.. 2021. “Kakila Database: Towards A Fair Community Approved Database Of Cetacean Presence In The Waters Of The Guadeloupe Archipelago Based On Citizen Science”. Biodiversity Data Journal 9. doi:10.3897/BDJ.9.e69022. https://bdj.pensoft.net/article/69022/.
-
Coché, Lorraine , Elie Arnaud, Laurent Bouveret, Romain David, Eric Foulquier, Nadège Gandilhon, Etienne Jeannesson, et al.. 2021. “Kakila Database: Towards A Fair Community Approved Database Of Cetacean Presence In The Waters Of The Guadeloupe Archipelago Based On Citizen Science”. Biodiversity Data Journal 9. doi:10.3897/BDJ.9.e69022. https://bdj.pensoft.net/article/69022/.
-
Coché, Lorraine , Elie Arnaud, Laurent Bouveret, Romain David, Eric Foulquier, Nadège Gandilhon, Etienne Jeannesson, et al.. 2021. “Kakila Database: Towards A Fair Community Approved Database Of Cetacean Presence In The Waters Of The Guadeloupe Archipelago Based On Citizen Science”. Biodiversity Data Journal 9. doi:10.3897/BDJ.9.e69022. https://bdj.pensoft.net/article/69022/.
-
Coché, Lorraine , Elie Arnaud, Laurent Bouveret, Romain David, Eric Foulquier, Nadège Gandilhon, Etienne Jeannesson, et al.. 2021. “Kakila Database: Towards A Fair Community Approved Database Of Cetacean Presence In The Waters Of The Guadeloupe Archipelago Based On Citizen Science”. Biodiversity Data Journal 9. doi:10.3897/BDJ.9.e69022. https://bdj.pensoft.net/article/69022/.
-
Hervé, Vincent , Josie Lambourdière, Malika René-Trouillefou, Damien Alain Devault, and Pascal Jean Lopez. 2021. “Sargassum Differentially Shapes The Microbiota Composition And Diversity At Coastal Tide Sites And Inland Storage Sites On Caribbean Islands”. Frontiers In Microbiology 12. doi:10.3389/fmicb.2021.701155. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.701155/full.
-
Devault, Damien A, Ronan Pierre, Hélène Marfaing, Franck Dolique, and Pascal Jean Lopez. 2021. “Sargassum Contamination And Consequences For Downstream Uses: A Review”. Journal Of Applied Phycology 33 (1): 567 - 602. doi:10.1007/s10811-020-02250-w. http://link.springer.com/10.1007/s10811-020-02250-w.
2020
-
Monti, Dominique , Cédric Hubas, Xavier Lourenço, Farid Begarin, Alexandre Haouisée, Laurence Romana, Estelle Lefrançois, et al.. 2020. “Physical Properties Of Epilithic River Biofilm As A New Lead To Perform Pollution Bioassessments In Overseas Territories”. Scientific Reports 10 (1). doi:10.1038/s41598-020-73948-7. http://www.nature.com/articles/s41598-020-73948-7.s41598-020-73948-7.pdf (5.19 MB)
- 1 of 2
- suivant ›