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Europe, Afrique, Amérique du Sud, Océanie

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Vers des Référentiels Taxonomiques Moléculaires en Eaux Continentales : Approche par Séquençage MinION
Description

L’objectif de ce projet est de renforcer les compétences du laboratoire en biologie moléculaire environnementale. Nous ambitionnons de construire des bases de référence moléculaires pour les habitats aquatiques de surface en Afrique du Sud, en Bolivie, en France et, potentiellement, en Australie. Pour cela, nous souhaitons acquérir l’expertise technique nécessaire au sein du laboratoire situé au 3ᵉ étage du 43 rue Cuvier, au MNHN Paris,  afin de réaliser certains séquençages directement sur place. Cette approche inclut le séquençage d’amplicons (PCR) ainsi que le séquençage long range. La technologie MinION, parfaitement complémentaire des autres méthodes de séquençage, doit être mise en œuvre directement au laboratoire. L’objectif est de constituer un référentiel robuste pour le développement des méthodes d’ADNe, en cohérence avec la taxonomie intégrative. Enfin, le matériel acquis sera mutualisé au sein de l’équipe BOREA au 3ᵉ étage, de la rue Cuvier.

Partners
  • Ibanez, Carla, IRD/FERRIA, UPEA, La Paz, Bolivie
  • Molina, Carlos, Institute of Ecology (UMSA), Bolivian Fauna Collection
  • Bonillo, Céline, ISYEB
  • Mlambo, Musa, Albany Museum
  • Motitsoe, Samuel, University oh the Witwatersrand
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