Cédric HUBAS
Mes recherches sont axées sur la compréhension du fonctionnement des communautés microbiennes. J'aborde cette question en articulant mes travaux autour des deux thématiques suivantes :
1/ Diversité et fonctionnement des biofilms et tapis microbiens : principalement dans les écosystèmes aquatiques (eau douce et marins). Je m’intéresse principalement aux écosystèmes côtiers avec une nette préférence pour la zone de balancement des marées. J'étudie la diversité des micro-organismes de ces biofilms ainsi que leur rôle dans le fonctionnement des écosystèmes.
2/ Les interactions dans les écosystèmes microbiens : entre les microorganismes (communication, ...) ou entre un hôte et un microorganisme (symbioses, ...)
Manuscrit de HDR : Biofilms, tapis et agrégats microbiens : vers une vision unificatrice 
Enseignant principalement l'écologie marine et les statistiques (univariées et multivariées), je suis également responsable de deux modules du MNHN : TC3-ini - Initiation aux statistiques et aux probabilités (https://edu.mnhn.fr/course/view.php?id=57) et ES10 - Biodiversité en milieu marin côtier : du gène à l'organisme (https://edu.mnhn.fr/course/view.php?id=326).
Mon engagement ne se limite pas à la salle de classe. Je suis actif sur mon compte Twitter (https://twitter.com/HubasC), où je partage les résultats de mes recherches et explique les avancées importantes dans le domaine de l'écologie marine et des statistiques. Je suis convaincu que la diffusion des connaissances est essentielle pour sensibiliser le public à l'importance de la préservation de notre environnement marin.
En parlant de diffusion des connaissances, j'aime également réaliser des expériences pour illustrer les concepts clés de l'écologie marine. L'une de ces expériences a été documentée dans un poster, mettant en évidence les changements observés dans une colonne de Winogradsky. Ce poster est disponible en téléchargement au DOI suivant :
Je suis chargé des collections méiofaune (http://www.mnhn.fr/fr/collections/ensembles-collections/invertebres-marins/meiofaune) et siponcles. La collection méiofaune rassemble près de 800 espèces différentes (et autant de types) sur lames, correspondant à plus de 3000 préparations microscopiques dont le recensement est informatisé sous JACIM. Cet ensemble comprend 8 embranchements différents (Annelida, Gastrotricha, Kinorhyncha, Loricifera, Nematoda, Platyhelminthes, Rotifera, Tardigrada) et s’accompagne d’une bibliothèque importante sur divers groupes vivant dans le milieu interstitiel.
Je participe au groupe de travail Directive Cadre sur l'Eau (DCE) « mangrove » depuis 2016. Le groupe de travail à pour but de répondre aux demandes du ministère et de l’Office Français de la Biodiversité (OFB) quant à la définition d’indicateurs du bon état écologique des mangroves côtières.
- Responsable UE ES10 et TC3-ini
- Co-responsable Equipe Somaqua
- Responsable scientifique du service MEB-FEG de la Station Marine de Concarneau
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Mes publications
2024
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. 2024. « The Metabolites Of Light: Untargeted Metabolomic Approaches Bring New Clues To Understand Light-Driven Acclimation Of Intertidal Mudflat Biofilm ». Science Of The Total Environment 912: 168692. doi:10.1016/j.scitotenv.2023.168692. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969723073205.
v2_covered_5c0f4269-6c03-4c76-b23f-6f5f1ddb682a.pdf (851.65 Ko) -
. 2024. « Deciphering Environmental Forcings In The Distribution Of Meiofauna And Nematodes In Mangroves Of The Atlantic-Caribbean-East Pacific And Indo-West Pacific Regions ». Science Of The Total Environment 930: 172612. doi:10.1016/j.scitotenv.2024.172612. https://www-sciencedirect-com.inee.bib.cnrs.fr/science/article/pii/S004896972402758X?via%3Dihub.
2023
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. 2023. « Sex-Specific Seasonal Variations In The Fatty Acid And Carotenoid Composition Of Sea Cucumber Gonads And Implications For Aquaculture ». Marine Biology 170 (4). doi:10.1007/s00227-023-04198-0. https://link.springer.com/10.1007/s00227-023-04198-0.
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. 2023. « Artificial Reef Effectiveness Changes Among Types As Revealed By Underwater Hyperspectral Imagery ». Restoration Ecology: e13978. doi:10.1111/rec.13978. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/rec.13978.
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. 2023. « Identification Of Microbial Exopolymer Producers In Sandy And Muddy Intertidal Sediments By Compound-Specific Isotope Analysis ». Peer Community Journal 3. doi:10.24072/pcjournal.336. https://peercommunityjournal.org/articles/10.24072/pcjournal.336/. 10_24072_pcjournal_336 (1).pdf (3.11 Mo)
2022
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. 2022. « Chlordecone-Contaminated Epilithic Biofilms Show Increased Adsorption Capacities ». Science Of The Total Environment 825: 153942. doi:10.1016/j.scitotenv.2022.153942. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969722010348.
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. 2022. « Mangrove Microbiota Along The Urban-To-Rural Gradient Of The Cayenne Estuary (French Guiana, South America): Drivers And Potential Bioindicators ». Science Of The Total Environment 807: 150667. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.150667. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969721057454.
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. 2022. « The Response Of Microphytobenthos To Physical Disturbance, Herbicide, And Titanium Dioxide Nanoparticle Exposure ». Marine Pollution Bulletin 185: 114348. doi:10.1016/j.marpolbul.2022.114348. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0025326X2201030X.
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. 2022. « Climate Change Influences Chlorophylls And Bacteriochlorophylls Metabolism In Hypersaline Microbial Mat ». Science Of The Total Environment 802: 149787. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.149787. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969721048622.
2021
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. 2021. « Trophic Niche Of The Invasive Gregarious Species Crepidula Fornicata, In Relation To Ontogenic Changes ». Biorxiv: 2020.07.30.229021. doi:10.1101/2020.07.30.229021. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.30.229021v1.abstract. Androuin_et_al_2020.pdf (2.4 Mo)
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. 2021. « First Assessment Of The Benthic Meiofauna Sensitivity To Low Human-Impacted Mangroves In French Guiana ». Forests 12 (3): 338. doi:10.3390/f12030338. https://www.mdpi.com/1999-4907/12/3/338.
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. 2021. « Environmental Heterogeneity Drives Phytoplankton Community Assembly Patterns In A Tropical Riverine System ». Peer Community In Ecology. doi:10.24072/pci.ecology.100083. https://ecology.peercommunityin.org/articles/rec?id=86.
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. 2021. « Towards A Better Understanding Of The Effects Of Self-Shading On Fucus Serratus Populations ». Peer Community In Ecology. doi:10.24072/pci.ecology.100086. https://ecology.peercommunityin.org/.
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. 2021. « Upstream/Downstream Food Quality Differences In A Caribbean Island River ». Aquatic Ecology. doi:10.1007/s10452-021-09887-w. https://link.springer.com/10.1007/s10452-021-09887-w. Frotté2021_Article_UpstreamDownstreamFoodQualityD.pdf (308.37 Ko)
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. 2021. « Photosynthesis From Stolen Chloroplasts Can Support Sea Slug Reproductive Fitness ». Proceedings Of The Royal Society B: Biological Sciences 288 (1959). doi:10.1098/rspb.2021.1779. https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rspb.2021.1779.
2020
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. 2020. « Relationship Between Bacterial Compartment And Particulate Organic Matter (Pom) In Coastal Systems: An Assessment Using Fatty Acids And Stable Isotopes ». Estuarine, Coastal And Shelf Science 239: 106720. doi:10.1016/j.ecss.2020.106720. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0272771419301593.
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. 2020. « Effect Of Light Intensity And Light Quality On Diatom Behavioral And Physiological Photoprotection ». Frontiers In Marine Science 7: 203. doi:10.3389/fmars.2020.00203. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2020.00203. fmars-07-00203.pdf (3.58 Mo)
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. 2020. « An Untargeted Metabolomic Approach For Microphytobenthic Biofilms In Intertidal Mudflats ». Frontiers In Marine Science 7: 250. doi:10.3389/fmars.2020.00250. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2020.00250. fmars-07-00250.pdf (2.41 Mo)
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. 2020. « Functional Kleptoplasts Intermediate Incorporation Of Carbon And Nitrogen In Cells Of The Sacoglossa Sea Slug Elysia Viridis ». Scientific Reports 10 (1). doi:10.1038/s41598-020-66909-7. http://www.nature.com/articles/s41598-020-66909-7. s41598-020-66909-7.pdf (8.23 Mo)
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. 2020. « Laminariales Host Does Impact Lipid Temperature Trajectories Of The Fungal Endophyte Paradendryphiella Salina (Sutherland.) ». Marine Drugs 18: 379. doi:10.3390/md18080379. https://www.mdpi.com/1660-3397/18/8/379. marinedrugs-18-00379.pdf (744.42 Ko)
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