Oxylipines du biofilm microphytobenthique induites par la lumière
Résumé
Les biofilms microphytobenthiques constituent le premier stade de colonisation des surfaces naturelles et des infrastructures humaines marines. Les microorganismes qui les constituent (microalgues, bactéries, champignons, etc) sont agencés au sein d’une substance extracellulaire polymérique qu’ils synthétisent.
Ce projet de recherche fondamentale vise à étudier la réponse du métabolisme lipidique (origine et rôle fonctionnel des oxylipines) des biofilms microphytobenthiques marins à la suite d’un stress d’irradiance. Ici, l’irradiance représente la quantité d’énergie solaire qui atteint les microorganismes photosynthétiques du biofilm. En milieu côtier, cette quantité d’énergie est amenée à varier considérablement et rapidement au cours d’une même journée.
Le sujet se situe à l’interface de nombreux domaines scientifiques (monde du microscopique, métabolisme lipidique, milieu marin, écologie benthique, physique des plasmas ou encore phylométabolomique) et s’organise autour des trois axes majeurs suivants :
Ce projet de recherche fondamentale vise à étudier la réponse du métabolisme lipidique (origine et rôle fonctionnel des oxylipines) des biofilms microphytobenthiques marins à la suite d’un stress d’irradiance. Ici, l’irradiance représente la quantité d’énergie solaire qui atteint les microorganismes photosynthétiques du biofilm. En milieu côtier, cette quantité d’énergie est amenée à varier considérablement et rapidement au cours d’une même journée.
Le sujet se situe à l’interface de nombreux domaines scientifiques (monde du microscopique, métabolisme lipidique, milieu marin, écologie benthique, physique des plasmas ou encore phylométabolomique) et s’organise autour des trois axes majeurs suivants :
- Effet de l’irradiance sur le métabolome des biofilms.
- Origine et rôle fonctionnel des oxylipines.
- Caractérisation des voies métaboliques impliquées.
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Microphytobenthic biofilms are the first stage of natural surfaces' colonization and human marine infrastructures. The microorganisms of those biofilms (microalgae, bacteria, fungi, etc.) are arranged within a polymeric extracellular substance that they synthesize.
The aim of this fundamental research project is to study the response of lipid metabolism (origin and functional role of oxylipins) in marine microphytobenthic biofilms to irradiance stress. In this case, irradiance represents the amount of solar energy reaching the photosynthetic microorganisms in the biofilm. In a coastal environment, this amount of energy can considerably and rapidly vary over a day.
The thesis research is at the interface of various scientific sectors (microscopic world, lipid metabolism, marine environment, benthic ecology, plasma physics or phylometabolomics) and is organized around the following three major axes:
- Effect of irradiance on the metabolome of biofilms.
- Functional role of oxylipins.
- Characterization of the metabolic pathways involved.
Auteur
DESPARMET Alexandre
Equipe
SOMAQUA