Identification of microbial exopolymer producers in sandy and muddy intertidal sediments by compound-specific isotope analysis
Identification of microbial exopolymer producers in sandy and muddy intertidal sediments by compound-specific isotope analysis
Identification of microbial exopolymer producers in sandy and muddy intertidal sediments by compound-specific isotope analysis/ Identification des producteurs microbiens d'exopolymères dans les sédiments intertidaux sableux et vaseux par analyse isotopique spécifique des composés
Référence
Hubas, Cédric ; Gaubert-Boussarie, Julie ; D’Hondt, An-Sofie ; Jesus, Bruno; Lamy, Dominique ; Meleder, Vona ; Prins, Antoine ; Rosa, Philippe ; Stock, Willem ; Sabbe, Koen. Identification of microbial exopolymer producers in sandy and muddy intertidal sediments by compound-specific isotope analysis. Peer Community Journal, Volume 3 (2023), article no. e104. doi : 10.24072/pcjournal.336. https://peercommunityjournal.org/articles/10.24072/pcjournal.336/
Dans les sédiments côtiers, les microorganismes vivant en biofilm et formant des colonies adhérentes les unes aux autres produisent des macromolécules connues sous le nom de "substances polymériques extracellulaires" (SPE). Bien que l'importance de ces molécules dans le fonctionnement des communautés microbiennes soit largement documentée depuis de nombreuses années, des lacunes significatives subsistent quant à l'identification précise des SPE ainsi que de leur origine, en raison de leur nature en tant que mélange hétérogène de molécules. Dans le cadre de notre étude, nous avons adopté une approche novatrice en comparant les rapports isotopiques du carbone et de l'azote des SPE à ceux des biomarqueurs d'acides gras. Cette méthodologie nous a permis de mettre en évidence une différence marquante dans l'influence des diatomées épipéliques et épipsammiques sur la composition chimique des SPE, avec des implications significatives pour la croissance des bactéries spécialisées dans l'utilisation de ces substances.
Cet article est disponible librement sur le serveur de preprint bioRxiv (https://doi.org/10.1101/2022.12.02.516908), il a été évalué et recommandé par Ute Risse-Buhl et Nils Rädecker d'après les commentaires de 2 évaluateurs anonymes via service de relecture Peer Community In Ecology (https://doi.org/10.24072/pci.ecology.100519). Les données brutes (https://doi.org/10.5281/zenodo.7351530) et les scripts d’analyses (https://doi.org/10.5281/zenodo.7387066 & https://github.com/Hubas-prog/EPS_FA_CSIA) sont disponibles en ligne. La version finale de l’article a été publiée dans la revue accès libre diamant Peer Community Journal (https://doi.org/10.24072/pcjournal.336) créée et financée par l'organisation à but non lucratif et non commerciale "Peer Community In" (PCI), qui publie les articles recommandés par PCI en libre accès, sans frais pour les auteurs et les lecteurs.
Contact BOREA : Cédric Hubas, professeur MNHN, cedric.hubas@mnhn.fr
