Cédric HUBAS
Mes recherches sont axées sur la compréhension du fonctionnement des communautés microbiennes. J'aborde cette question en articulant mes travaux autour des deux thématiques suivantes :
1/ Diversité et fonctionnement des biofilms et tapis microbiens : principalement dans les écosystèmes aquatiques (eau douce et marins). Je m’intéresse principalement aux écosystèmes côtiers avec une nette préférence pour la zone de balancement des marées. J'étudie la diversité des micro-organismes de ces biofilms ainsi que leur rôle dans le fonctionnement des écosystèmes.
2/ Les interactions dans les ecosystèmes microbiens : entre les microorganismes (communication, ...) ou entre un hôte et un microorganisme (symbioses, ...)
Manuscrit de HDR : Biofilms, tapis et agrégats microbiens : vers une vision unificatrice 
J'enseigne principalement l'écologie marine et les statistiques (univariées et multivariées). Je suis responsable du module optionnel TC3-ini : initiation aux statistiques et aux probabilités (http://plateforme-depf.mnhn.fr/course/view.php?id=57).
Je réalise des expériences destinées à la diffusion des connaissances. Ci dessous une expérience consistant à documenter les changements observés dans une colonne de Winogradsky. Ce poster est disponible au téléchargement à l'adresse suivante : 
Je suis chargé des collections méiofaune (http://www.mnhn.fr/fr/collections/ensembles-collections/invertebres-marins/meiofaune) et siponcles. La collection méiofaune rassemble près de 800 espèces différentes (et autant de types) sur lames, correspondant à plus de 3000 préparations microscopiques dont le recensement est informatisé sous JACIM. Cet ensemble comprend 8 embranchements différents (Annelida, Gastrotricha, Kinorhyncha, Loricifera, Nematoda, Platyhelminthes, Rotifera, Tardigrada) et s’accompagne d’une bibliothèque importante sur divers groupes vivant dans le milieu interstitiel.
Je participe au groupe de travail Directive Cadre sur l'Eau (DCE) « mangrove » depuis 2016. Le groupe de travail à pour but de répondre aux demandes du ministère et de l’Office Français de la Biodiversité (OFB) quant à la définition d’indicateurs du bon état écologique des mangroves cotières.
- Responsable UE ES10 et TC3-ini
- Co-responsable Equipe Somaqua
- Responsable scientifique du service MEB-FEG de la Station Marine de Concarneau
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Mes publications
2022
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. 2022. « Climate Change Influences Chlorophylls And Bacteriochlorophylls Metabolism In Hypersaline Microbial Mat ». Science Of The Total Environment 802: 149787. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.149787. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969721048622.
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. 2022. « Chlordecone-Contaminated Epilithic Biofilms Show Increased Adsorption Capacities ». Science Of The Total Environment 825: 153942. doi:10.1016/j.scitotenv.2022.153942. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969722010348.
2021
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. 2021. « First Assessment Of The Benthic Meiofauna Sensitivity To Low Human-Impacted Mangroves In French Guiana ». Forests 12 (3): 338. doi:10.3390/f12030338. https://www.mdpi.com/1999-4907/12/3/338.
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. 2021. « Environmental Heterogeneity Drives Phytoplankton Community Assembly Patterns In A Tropical Riverine System ». Peer Community In Ecology. doi:10.24072/pci.ecology.100083. https://ecology.peercommunityin.org/articles/rec?id=86.
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. 2021. « Towards A Better Understanding Of The Effects Of Self-Shading On Fucus Serratus Populations ». Peer Community In Ecology. doi:10.24072/pci.ecology.100086. https://ecology.peercommunityin.org/.
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. 2021. « Upstream/Downstream Food Quality Differences In A Caribbean Island River ». Aquatic Ecology. doi:10.1007/s10452-021-09887-w. https://link.springer.com/10.1007/s10452-021-09887-w.
Frotté2021_Article_UpstreamDownstreamFoodQualityD.pdf (308.37 Ko) -
. 2021. « Photosynthesis From Stolen Chloroplasts Can Support Sea Slug Reproductive Fitness ». Proceedings Of The Royal Society B: Biological Sciences 288 (1959). doi:10.1098/rspb.2021.1779. https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rspb.2021.1779.
2020
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. 2020. « Functional Kleptoplasts Intermediate Incorporation Of Carbon And Nitrogen In Cells Of The Sacoglossa Sea Slug Elysia Viridis ». Scientific Reports 10 (1). doi:10.1038/s41598-020-66909-7. http://www.nature.com/articles/s41598-020-66909-7. s41598-020-66909-7.pdf (8.23 Mo)
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. 2020. « Laminariales Host Does Impact Lipid Temperature Trajectories Of The Fungal Endophyte Paradendryphiella Salina (Sutherland.) ». Marine Drugs 18: 379. doi:10.3390/md18080379. https://www.mdpi.com/1660-3397/18/8/379. marinedrugs-18-00379.pdf (744.42 Ko)
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. 2020. « Food Sources, Digestive Efficiency And Resource Allocation In The Sea Cucumber Holothuria Forskali (Echinodermata: Holothuroidea): Insights From Pigments And Fatty Acids ». Aquaculture Nutrition 26 (5): 1568-1583. doi:10.1111/anu.13103. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/anu.13103.
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. 2020. « Trophic Niche Of The Invasive Gregarious Species Crepidula Fornicata, In Relation To Ontogenic Changes ». Biorxiv: 2020.07.30.229021. doi:10.1101/2020.07.30.229021. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.30.229021v1.abstract. Androuin_et_al_2020.pdf (2.4 Mo)
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. 2020. « Novel Α-Hydroxy Γ-Butenolides Of Kelp Endophytes Disrupt Bacterial Cell-To-Cell Signaling ». Frontiers In Marine Science 7. doi:10.3389/fmars.2020.0060110.3389/fmars.2020.00601.s001. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2020.00601/full.
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. 2020. « Physical Properties Of Epilithic River Biofilm As A New Lead To Perform Pollution Bioassessments In Overseas Territories ». Scientific Reports 10 (1). doi:10.1038/s41598-020-73948-7. http://www.nature.com/articles/s41598-020-73948-7. s41598-020-73948-7.pdf (5.19 Mo)
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. 2020. « Relationship Between Bacterial Compartment And Particulate Organic Matter (Pom) In Coastal Systems: An Assessment Using Fatty Acids And Stable Isotopes ». Estuarine, Coastal And Shelf Science 239: 106720. doi:10.1016/j.ecss.2020.106720. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0272771419301593.
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. 2020. « Effect Of Light Intensity And Light Quality On Diatom Behavioral And Physiological Photoprotection ». Frontiers In Marine Science 7: 203. doi:10.3389/fmars.2020.00203. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2020.00203. fmars-07-00203.pdf (3.58 Mo)
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. 2020. « An Untargeted Metabolomic Approach For Microphytobenthic Biofilms In Intertidal Mudflats ». Frontiers In Marine Science 7: 250. doi:10.3389/fmars.2020.00250. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2020.00250. fmars-07-00250.pdf (2.41 Mo)
2019
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. 2019. « Bacterial–Fungal Interactions In The Kelp Endomicrobiota Drive Autoinducer-2 Quorum Sensing ». Frontiers In Microbiology 10: 1693. doi:10.3389/fmicb.2019.01693. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2019.01693. fmicb-10-01693.pdf (3.74 Mo)
2018
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. 2018. « Subtidal Microphytobenthos: A Secret Garden Stimulated By The Engineer Species Crepidula Fornicata ». Frontiers In Marine Science 5. doi:10.3389/fmars.2018.00475. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2018.00475/full.
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. 2018. « Diel Rhythm Does Not Shape The Vertical Distribution Of Bacterial And Archaeal 16S Rrna Transcript Diversity In Intertidal Sediments: A Mesocosm Study ». Microbial Ecology 75 (2): 364-374. doi:10.1007/s00248-017-1048-1. https://doi.org/10.1007/s00248-017-1048-1. Lavergne et al 2017-Microbial Eoclogy-ONLINE-VERSION-2017-08-04.pdf (1.42 Mo)
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. 2018. « Strengths, Weaknesses, And Opportunities Of French Research In Trophic Ecology ». Comptes Rendus Biologies: -. doi:https://doi.org/10.1016/j.crvi.2018.05.001. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1631069118300830. 1-s2.0-S1631069118300830-main-2.pdf (2.34 Mo)
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