Benthologue, je travaille sur l'écologie des macro-invertébrés marins épi-benthiques de l'océan Austral et de l'océan Indien. Mon activité scientifique est structurée en trois versants : la recherche fondamentale, l'expertise institutionnelle et l'ingénierie scientifique.
Dans le cadre de mes activités de recherche, je m'intéresse à l'étude de la structuration des communautés benthiques profondes et aux mécanismes de forçage environnemental susceptibles d'exercer une influence sur la composition de ces communautés. Je privilégie la production naturaliste de données primaires d'observation de haute qualité pour documenter la présence des taxons dans mes différents sites d'étude et pour alimenter les modèles sur lesquels reposent mes analyses. J'utilise principalement des approches de modélisation spatiale comme outil d'investigation des relations entre les paramètres abiotiques et la composition taxonomique et morpho-fonctionnelle des communautés. Pour consolider mes réflexions, je m'appuie sur la diversité des écosystèmes que j'observe, aux plans bathymétrique (de 90 à 2000 mètres de profondeur), géomorphologique (plateaux continentaux, monts sous-marins, structures récifales) et bio-géographique (gradient latitudinal depuis les eaux subtropicales de l'océan Indien sud jusqu'au continent antarctique).
En dehors du laboratoire, en prolongement bénévole d'activités professionnelles antérieures, je maintiens également une pratique naturaliste généraliste de manière autonome et via divers cadres associatifs. Mon compte sur INaturalist -> https://www.inaturalist.org/people/alexis_martin_fr
J'interviens ponctuellement dans des enseignements du Master et de l’École Doctorale du Muséum national d'Histoire naturelle, dans les domaines de l'écologie marine et de l'imagerie scientifique. Je suis également intervenant au sein de la formation professionnelle des observatrices et observateurs scientifiques des pêches proposée par l'unité BOREA et le service de formation continue du Muséum.
Après avoir démarré ma carrière au Muséum comme technicien de collections naturalistes dans les laboratoires d'Anatomie Comparée et de Zoologie Mammifères et Oiseaux, avec une spécialité en ostéologie, ma contribution aux activités de conservation de l'établissement porte aujourd'hui sur :
- les collections d'étude d'invertébrés marins issues des collectes réalisées lors des campagnes scientifiques de l'UMR BOREA ou par les contrôleuses et contrôleurs de pêche des TAAF dans le cadre du programme POEPA
- les collections numériques de données produites dans le cadre du programme POEPA
- le fond documentaire des Terres Australes et Antarctiques Françaises conservé par le service des archives de la Bibliothèque Centrale du Muséum
Je réinvestis mes résultats de recherche dans mon activité d'expertise scientifique institutionnelle auprès des opérateurs publics de la gestion de la mer, de la régulation de la pêche et de la protection de la biodiversité (Ministère de la Transition Écologique (MTE), Terres Australes et Antarctiques Françaises), ainsi qu'auprès des organismes internationaux liés aux traités ratifiés par la France dans desquels je suis missionné en tant qu'expert officiel. Dans les Zones Économiques Exclusives de Kerguelen, de Crozet et de Saint-Paul et Amsterdam, je produis des avis scientifiques sur la pression exercée par les activités de pêche sur les écosystèmes benthiques. Je travaille également sur la détection et sur le suivi des milieux classés au plan réglementaire comme "Écosystèmes Marins Vulnérables" (EMV) et sur la mise en place d'aires marines protégées. Dans les eaux internationales, je contribue aux travaux des Comités Scientifiques des traités APSOI et CCAMLR pour la prise en compte de la problématique des EMV dans les accords multilatéraux négociés entre les états signataires. Doté d'une formation initiale de technicien supérieur agricole en gestion des espaces naturels, je contribue régulièrement à la rédaction et à la mise à jour des plans de gestion de ces différents territoires.
Dans le domaine de l'ingénierie scientifique, je me suis spécialisé dans l'acquisition et la valorisation des données naturalistes de terrain. Au plan organisationnel et managérial, je travaille sur la construction de chaînes opérationnelles allant de la collecte des données et des échantillons jusqu'à leur bancarisation et leur valorisation scientifique, en assurant l'encadrement des équipes associées. Au plan logiciel, je possède une expertise dans la création de bases de données pour la biodiversité, dans le développement de pipelines de traitement des données et j'explore depuis l'époque de l'émergence du big data les nouvelles possibilités offertes par les technologies dites d'intelligence artificielle. Au plan instrumental, j'ai initié et je co-dirige un programme de développement de caméras sous-marines autonomes (le projet Bendicam) destiné à la massification de la collecte des données naturalistes dans les écosystèmes marins profonds.
- co-direction scientifique du Programme d'Observation Écosystémique des Pêcheries Australes (POEPA) de l'équipe AQUATREND/BOREA
- pilotage du pôle d'acquisition des données de POEPA
- chef de la délégation française au Comité Scientifique du traité APSOI
- élu du personnel au Comité Social d'Administration du Muséum, ancien élu du Conseil Scientifique, du Conseil d'Administration et de la Commission Consultative Paritaire des agents contractuels
- gestion et suivi financier de la convention socle du programme POEPA entre le MNHN et la Direction générale des affaires maritimes, de la pêche et de l'aquaculture (DGAMPA) du MTE
- gestion RH et encadrement de l'équipe de chargé.es d'études scientifiques recrutés sur la convention
