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Dominique LAMY
Ancien membre du laboratoire
Mon travail de recherche s’inscrit dans le cadre d’une approche globale de la structure et du fonctionnement des écosystèmes aquatiques, qui requiert en amont (i) l’étude in situ de la structure et de la fonction des compartiments qui les composent, et (ii) la caractérisation fine des liens trophiques qui peuvent s’établir entre ces compartiments. Parmi ces compartiments, les procaryotes sont des acteurs essentiels dans les transferts de matière organique et d’énergie au sein des réseaux trophiques. Mes activités de recherche visent à mieux comprendre le rôle des procaryotes planctoniques dans les flux de matière et d’énergie en milieux marins (côtier et océan profond) et lacustres, et identifier les paramètres forçant leur répartition, leurs activités, et leur diversité génétique et fonctionnelle. Ainsi, j’utilise des méthodes d’estimation de leur abondance, de leurs activités de production et de dégradation de la matière organique, couplées à des mesures de la structure, génétique et fonctionnelle, de leurs communautés.
Mots-clés : Ecologie ; Réseau trophique ; Procaryotes planctoniques (Bactéries et Archées) ; Biomasse ; Production et dégradation de matière ; Diversité génétique et fonctionnelle
Mes activités d’enseignement se déroulent à Sorbonne Université (SU) sur le campus de Jussieu. Elles concernent principalement l’enseignement des statistiques et l’utilisation du logiciel R (logiciel de traitement de données) à l’attention des étudiants biologistes de Licence 2, L3 et Master 1 de SU. J’interviens également en Licence 2 pour des enseignements en Ecologie marine et en Licence 3, & Master 1 et 2 pour des enseignements d’Ecologie microbienne.
Je suis co-responsable de la partie « Statistiques » d’une Unité d’Enseignement Commune de Licence 3 de SU intitulée « Statistiques et Mathématiques pour la Biologie », et co-responsable d'une UE commune de Master 1 (SDUEE) intitulée "Données, Statistiques et Analyses de données".
Mots-clés : Biostatistiques ; logiciel R ; Ecologie microbienne ; Ecologie marine
Référente site internet BOREA - équipe SOMAQUA
Mes publications
2023
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Hubas, Cédric , Julie Gaubert-Boussarie, An-Sofie D’Hondt, Bruno Jesus, Dominique Lamy, Vona Meleder, Antoine Prins, Philippe Rosa, Willem Stock, et Koen Sabbe. 2023. « Identification Of Microbial Exopolymer Producers In Sandy And Muddy Intertidal Sediments By Compound-Specific Isotope Analysis ». Peer Community Journal 3. doi:10.24072/pcjournal.336. https://peercommunityjournal.org/articles/10.24072/pcjournal.336/.10_24072_pcjournal_336 (1).pdf (3.11 Mo)
2022
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Fiard, Maud , Philippe Cuny, Léa Sylvi, Cédric Hubas, Ronan Jézéquel, Dominique Lamy, Romain Walcker, et al.. 2022. « Mangrove Microbiota Along The Urban-To-Rural Gradient Of The Cayenne Estuary (French Guiana, South America): Drivers And Potential Bioindicators ». Science Of The Total Environment 807: 150667. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.150667. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969721057454.
2021
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David, Frank , Tarik Meziane, Cyril Marchand, Guillaume Rolland, Aurélie Pham, Nguyen Thanh-Nho, et Dominique Lamy. 2021. « Prokaryotic Abundance, Cell Size And Extracellular Enzymatic Activity In A Human Impacted And Mangrove Dominated Tropical Estuary (Can Gio, Vietnam) ». Estuarine, Coastal And Shelf Science: 107253. doi:10.1016/j.ecss.2021.107253. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0272771421000895.
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Michelet, Claire , Daniela Zeppilli, Cédric Hubas, Elisa Baldrighi, Philippe Cuny, Guillaume Dirberg, Cécile Militon, et al.. 2021. « First Assessment Of The Benthic Meiofauna Sensitivity To Low Human-Impacted Mangroves In French Guiana ». Forests 12 (3): 338. doi:10.3390/f12030338. https://www.mdpi.com/1999-4907/12/3/338.
2019
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Berg, Jasmine S, Didier Jézéquel, Arnaud Duverger, Dominique Lamy, Christel Laberty-Robert, et Jennyfer Miot. 2019. « Microbial Diversity Involved In Iron And Cryptic Sulfur Cycling In The Ferruginous, Low-Sulfate Waters Of Lake Pavin ». Plos One 14: e0212787. doi:10.1371/journal.pone.0212787. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0212787.
2018
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Riera, Elisabeth , Dominique Lamy, Christophe Goulard, P Francour, et Cédric Hubas. 2018. « Biofilm Monitoring As A Tool To Assess The Efficiency Of Artificial Reefs As Substrates: Toward 3D Printed Reefs ». Ecological Engineering 120: 230 - 237. doi:https://doi.org/10.1016/j.ecoleng.2018.06.005. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0925857418302167.2018.Riera et al.pdf (597.83 Ko)
2016
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Lamy, Dominique , Marine Robuchon, L. Kervran, B. Dennetiere, Eric Feunteun, et L. Le Gall. 2016. « Dinard Herbarium: History Of A Marine Station1 ». Cryptogamie, Algologie 37: 29-45. doi:10.7872/crya/v37.iss1.2016.29. https://bioone.org/journals/Cryptogamie-Algologie/volume-37/issue-1/v37.iss1.2016.29/Dinard-Herbarium-History-of-a-Marine-Station1/10.7872/crya/v37.iss1.2016.29.short.
2014
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Vojvoda, Jana , Dominique Lamy, Eva Sintes, Juan AL Garcia, Valentina Turk, et Gerhard J Herndl. 2014. « Seasonal Variation Of Marine Snow-Associated And Ambient Water Prokaryotic Communities In The Northern Adriatic Sea ». Aquatic Microbial Ecology 73: 211-224.