Francis ORVAIN
Francis Orvain est Maître de conférence (HDR et PEDR) dans l’équipe ‘Diversité et Interaction dans les écosystèmes côtiers’ de l’UMR BOREA. Il a 41 ans et a publié 31 articles de rang A en 2015 (H-index de 13). Il est spécialiste des relations entre habitats sédimentaire et les communautés benthiques (microphytobenthos et macrozoobenthos) aux interfaces eau-sédiment des écosystèmes côtiers, des espèces ingénieurs d’écosystèmes, bioturbation, biostabilisation (EPS) et érosion. Il est modélisateur du transport sédimentaire sous influence des activités biologiques (couplage physique/biologie) avec de nombreux papiers sur le sujet (thèse en modélisation). Il a été leader de plusieurs actions comme le WP couplage physique/biologie de l’ANR Blanc VASIREMI (2007-2011) et de projets régionaux (CRBN/AESN/CG14/CG50) comme GECOGECO (Gestion des Ecosystêmes Côtiers pour guider l’Exploitation de la Coque 2012-2013). Il est également pilote du projet Seine-Aval 5 BARBèS (Biological Association in Relation with sediment transport: Development of a new model of Bioturbation caused by ecosystem Engineers in Seine estuary 2014-2017). Dans tous ces projets, il a réalisés des tests d’érodimétrie en laboratoire et in situ pour quantifier le rôle joué par les composants microphytobenthiques et macrozoobenthiques sur l’érosion sédimentaire et l’exportation de microphytobenthique et de microorganismes pour développer des modèles numériques et mécanistiques de bioturbation. Il est aussi membre du réseau national RESOMAR (Benthos) et a soumis un projet EC2CO-DRIL appelé UNDER-PRESSURE (qui vise à fournir des indicateurs écologiques de l’impact de la pêche sur les communautés benthiques et les habitats sédimentaires). Dans de nombreux projets (GECO-GECO, SA5-BARBES, ANR GIGASSAT traitant de l’impact du changement global sur les mortalités de masse de l’huître creuse Crassostrea gigas), il réalise des cartes des communautés macrozoobenthiques et microphytobenthique pour mieux comprendre le fonctionnement des zones estuariennes conchylicoles et le couplage benthos-pélagos.
Etablissement : IUT de Caen, département Génie Biologique : DUT Génie biologique L1, DUT Génie de l’environnement L2, L3 pro Génie de l’environnement et développement durable. 270 h eq TD en 2014 (voir CV détaillé): Ecologie, Gestion de l'environnement, biostatistique cartographie, Embryologie, Systématique animale, Histologie
Disciplines : Ecologie, Développement durable, Biologie marine, Statistiques, Analyses multivariées, Géostatistiques, biologie des populations et des écosystèmes, Systématique animale.
- Encadrement doctoral de 2 docteurs (M. De Crignis 2007-2010 50 %, M. Ubertini 2009-2012 80 %) et directeur de thèse de C. Rakotomalala (2012-2015)
- Rapporteur de 4 thèses de doctorat (Guillaume Bernard, Claire Passarelli, Ismaël Benyoucef, Arnab Chatterjee) et examinateur pour 3 autres (Guillaume Pierre, Margot de Crignis, Souhila Gouali).
- Referee pour 10 journaux de rang A et 2 projets européens (Research Foundation Flanders (Fonds Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen, FWO)
- Expertise pour le CS de l’UBO (Brest) pour 2 HDR
- Expertises scientifiques pour commission de spécialistes et comités de sélection pour 7 postes de MCF (Caen, Nantes, Lille 1, La Rochelle, Bordeaux)
- 2010-2014 : Représentant BENTHOS de la station marine de Luc sur mer au sein du RESOMAR (Réseau des stations et laboratoires marins) – Participation à l’ensemble des ring-test (intercalibration de la taxonomie macrozoobenthique entre station marine) et participation aux ateliers annuels de taxonomie ainsi que contribution à la constitution de la base de données nationale RESOMAR (depuis 2012). Organisation d'un atelier SYSTEMATIQUE à Caen en juillet 2016
- Participant au comité de pilotage d'un projet de modélisation : Réhabilitation des vasières en entuaire de Seine (Artelia - Port autonome du Havre)
- Membre élu au Conseil National des Universités (CNU section 67 Biologie des Populations et des Ecosystèmes) depuis 2010
- Directeur d’étude de la première année de DUT Génie biologique (112 étudiants) de 2004 à 2008
- Directeur d’étude de la licence professionnelle Génie de l’Environnement et Développement Durable (GEDD) à l’IUT de Caen depuis septembre 2013 (28 étudiants)
- Membre du CAS du CREC (depuis 2012)
- Membre du conseil de laboratoire FRE BioMEA (2012-2013)
- Responsabilité de contrats de recherche (voir CV détaillé)
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Mes publications
2021
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. 2021. « Marine Artificial Reefs, A Meta-Analysis Of Their Design, Objectives And Effectiveness ». Global Ecology And Conservation: e01538. doi:10.1016/j.gecco.2021.e01538. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S2351989421000883.
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. 2021. « Influence Of Infrastructure Material Composition And Microtopography On Marine Biofilm Growth And Photobiology ». Biofouling: 1 - 17. doi:10.1080/08927014.2021.1959918. https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/08927014.2021.1959918.
2020
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. 2020. « Evidence For Better Microphytobenthos Dynamics In Mixed Sand/Mud Zones Than In Pure Sand Or Mud Intertidal Flats (Seine Estuary, Normandy, France) ». Plos One 15 (8): e0237211. doi:10.1371/journal.pone.0237211.
Morelle et al 2020 journal.pone_.0237211.pdf (2.76 Mo) -
. 2020. « Does Parasitism Influence Sediment Stability? Evaluation Of Trait-Mediated Effects Of The Trematode Bucephalus Minimus On The Key Role Of Cockles Cerastoderma Edule In Sediment Erosion Dynamics ». Science Of The Total Environment 733: 139307. doi:10.1016/j.scitotenv.2020.139307. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969720328242.
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. 2020. « Sediment Stability: Can We Disentangle The Effect Of Bioturbating Species On Sediment Erodibility From Their Impact On Sediment Roughness? ». Marine Environmental Research 162: 105147. doi:10.1016/j.marenvres.2020.105147. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0141113620305055.
2019
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. 2019. « Modelling The Functioning Of A Coupled Microphytobenthic-Eps-Bacterial System In Intertidal Mudflats ». Marine Environmental Research 150. doi:10.1016/j.marenvres.2019.104754. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0141113619300704.
2018
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. 2018. « Annual Phytoplankton Primary Production Estimation In A Temperate Estuary By Coupling Pam And Carbon Incorporation Methods ». Estuaries And Coasts. s12237-018-0369-8(1).pdf (2.59 Mo)
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. 2018. « A Simple, User Friendly Tool To Readjust Raw Pam Data From Field Measurements To Avoid Over- Or Underestimating Of Microphytobenthos Photosynthetic Parameters ». Journal Of Experimental Marine Biology And Ecology 503: 136-146. doi:https://doi.org/10.1016/j.jembe.2018.02.007. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022098117303325.
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. 2018. « Dynamics Of Exopolymeric Carbon Pools In Relation With Phytoplankton Succession Along The Salinity Gradient Of A Temperate Estuary (France) ». Estuarine, Coastal And Shelf Science 209: 18-29.
2017
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. 2017. « Regional And Latitudinal Patterns Of Soft-Bottom Macrobenthic Invertebrates Along French Coasts: Results From The Resomar Database ». Journal Of Sea Research 130: 96 - 106. doi:https://doi.org/10.1016/j.seares.2017.03.011. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1385110116302660. Gallon et al 2017 JSR.pdf (953.14 Ko)
2015
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. 2015. « Artificial Reef: Multiscale Monitoring Of Colonization And Primary Production - Récif Artificiel: Mise En Place D’un Suivi De La Colonisation A Plusieurs Échelles ». Proceedings Of The Congress On Artificial Reefs : From Materials To Ecosystems . ESITC Caen.
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. 2015. « Chemical Interaction Between Epilitic Microphytobenthic Biofilm And Larval Development Of The Sea Urchin Paracentrotus Lividus ». Proceedings Of The Congress On Artificial Reefs : From Materials To Ecosystems. ESITC Caen.
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. 2015. « Impact Of Sediment Grain-Size And Biofilm Age On Epipelic Microphytobenthos Resuspension ». Journal Of Experimental Biology And Ecology 467: 52-64. Ubertini etal 2015.pdf (1.48 Mo)
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. 2015. « Modelling The Effect Of Cerastoderma Edule Bioturbation On Microphytobenthos Resuspension Towards The Planktonic Food Web Of Estuarine Ecosystem ». Ecological Modelling 316: 155-167.
2014
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. 2014. « How Does The Resuspension Of The Biofilm Alter The Functioning Of The Benthos-Pelagos Coupled Food Web Of A Bare Mudflat In Marennes-Oléron Bay (Ne Atlantic)? ». Journal Of Sea Research 92: 144-157. doi:10.1016/j.seares.2014.02.003. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S138511011400029X.
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. 2014. « Tidal And Seasonal Effects On The Short-Term Temporal Patterns Of Bacteria, Microphytobenthos And Exopolymers In Natural Intertidal Biofilms (Brouage, France) ». Journal Of Sea Research 92: 6-18. Orvain et al 2014a JSR.pdf (868.22 Ko)
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. 2014. « Relevance Of Macrozoobenthic Grazers To Understand The Dynamic Behaviour Of Sediment Erodibility And Microphytobenthos Resuspension In Sunny Summer Conditions ». Journal Of Sea Research 92: 46-55. Orvain et al 2014b JSR.pdf (584.84 Ko)
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. 2014. « Structures Of Benthic Prokaryotic Communities And Their Hydrolytic Enzyme Activities Resuspended From Samples Of Intertidal Mudflats: An Experimental Approach ». Journal Of Sea Research 92: 158-169. Mallet et al 2014 CSR.pdf (1.54 Mo)
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. 2014. « Bacterial Dynamics In A Microphytobenthic Biofilm: A Tidal Mesocosm Approach ». Journal Of Sea Research 92: 144-157. Agogué et al. 2014.pdf (1 Mo)
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. 2014. « Seasonal Dynamics Of Extracellular Polymeric Substances (Eps) In Surface Sediments Of A Diatom-Dominated Intertidal Mudflat (Marennes–Oléron, France) ». Journal Of Sea Research 92: 26-35. Pierre etal 2014 JSR.pdf (620.88 Ko)
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