BIOPAC - Biodiversité, plasticité, adaptation et conservation : des espèces aux communautés
La connaissance des mécanismes qui régulent la structure, la dynamique, le fonctionnement et le devenir des peuplements aquatiques est indispensable à l’élaboration de modèles et est un préalable à la proposition d’outils de gestion des espèces et des habitats d’intérêt écologique, patrimonial et/ou halieutique. Il convient donc d’étudier la diversité des groupes taxonomiques et leurs traits d’histoire de vie afin de comprendre les relations entre la biodiversité et l'écosystème. Notre équipe a développé des compétences dans l’étude des communautés des milieux particuliers que sont les mers australes, les systèmes insulaires tropicaux et les milieux côtiers et dulçaquicoles tempérés en s’appuyant sur d’importantes bases de données et des collections de références qu’elle a constituées. Les milieux étudiés sont soumis à de fortes perturbations de nature climatique (dépressions cycloniques, gel…), hydraulique (forte pluviométrie, crues dévastatrices, courants marins forcés …), hydrodynamiques (fronts, marées, processus de rétention,…) ou mécaniques d’érosion qui conduisent à une adaptation particulière des organismes qui y vivent, tant sur le processus de colonisation et d’installation que de dispersion. Dans ce contexte nos recherches se développent en 4 thèmes majeurs : (1) Description, origine et évolution de la biodiversité, (2) Plasticité et adaptations au cours du développement, (3) Dispersion et migrations et (4) Macroécologie et conservation.
Description, origine et évolution de la biodiversité
Nos travaux portent sur l’origine de la mise en place de la faune aquatique actuelle à la suite des recolonisations postglaciaires et à la persistance de zones refuges ; à l’exploration de la biodiversité des îles et de la diversité des assemblages ; et à l’étude biogéographique de la diversité de l’océan Austral à méso- et macro-échelle sur le pelagos et à l’échelle des plateaux pour les organismes benthiques et démersaux.
Plasticité et adaptations au cours du développement
Les organismes aquatiques présentent souvent des cycles de vie complexes, alternant phases de vie larvaire planctonique et phases de vie juvénile et adulte variées. C’est souvent à travers ces phases larvaires que se fait la dispersion des espèces, avant l’installation des adultes. Dans ce contexte l’équipe étudie la diversité et la plasticité des traits de vie et des réponses adaptatives de certains crustacés.
Dispersion et migrations
Notre équipe étudie les espèces aquatiques migratrices qui ont développé des traits de vie spécifiques leur permettant de coloniser des milieux particuliers et/ou de changer d’habitats au cours des différentes phases de leur cycle biologique. Les stratégies de dispersion représentent, en effet, un moteur essentiel de la structuration et de la persistance des communautés allant de l’échelle locale du cours d’eau, d’une île ou d’un archipel, à l’échelle régionale. La diadromie, est l’un des modèles les plus étudiés par l’équipe. Elle constitue une stratégie de vie avec des migrations entre des écosystèmes marins et dulçaquicoles.
Macroécologie et conservation
Nos travaux cherchent (i) à décrire les patrons de biodiversité et leur dynamique à plusieurs échelles spatiales et plusieurs niveaux d’organisation du vivant ; (ii) à relier ces patrons non seulement aux processus qui les sous-tendent, mais à en rechercher aussi les forçages directs ou indirects tels que les changements globaux ou anthropiques; (iii) à produire à partir de cette connaissance des indicateurs d’état et de tendance prédictive afin de mieux orienter les politiques et programmes de conservation.
Derniers articles scientifiques
2020
-
. 2020. « Deciphering Shell Proteome Within Different Baltic Populations Of Mytilid Mussels Illustrates Important Local Variability And Potential Consequences In The Context Of Changing Marine Conditions. ». Sci Total Environ 745: 140878. doi:10.1016/j.scitotenv.2020.140878.
-
. 2020. « Stable Species Boundaries Despite Ten Million Years Of Hybridization In Tropical Eels ». Nature Communications 11 (1). doi:10.1038/s41467-020-15099-x. https://www.nature.com/articles/s41467-020-15099-x.
-
. 2020. « Deciphering Mollusc Shell Production: The Roles Of Genetic Mechanisms Through To Ecology, Aquaculture And Biomimetics. ». Biol Rev Camb Philos Soc. doi:10.1111/brv.12640.
-
. 2020. « The Dance Of The Cape Gannet May Contain Social Information On Foraging Behaviour ». Animal Behaviour 166: 95-108.
-
. 2020. « Biodiversity Inventory Of The Grey Mullets (Actinopterygii: Mugilidae) Of The Indo‐Australian Archipelago Through The Iterative Use Of Dna‐Based Species Delimitation And Specimen Assignment Methods ». Evolutionary Applications. doi:10.1111/eva.12926. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/eva.12926.
-
. 2020. « Response Of Phytoplankton Traits To Environmental Variables In French Lakes: New Perspectives For Bioindication ». Ecological Indicators 108: 105659. doi:10.1016/j.ecolind.2019.105659. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1470160X19306521.
-
. 2020. « Looking For Environmental And Endocrine Factors Inducing The Transformation Of Sicyopterus Lagocephalus (Pallas 1770) (Teleostei: Gobiidae: Sicydiinae) Freshwater Prolarvae Into Marine Larvae ». Aquatic Ecology 54 (1): 163 - 180. doi:10.1007/s10452-019-09734-z. http://link.springer.com/10.1007/s10452-019-09734-z.
-
. 2020. « Microbial Functional Structure And Stable Isotopic Variation Of Leptocephali Across Three Current Zones In The Western South Pacific ». Progress In Oceanography 182: 102264. doi:10.1016/j.pocean.2020.102264. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0079661120300021.
-
. 2020. « Exploring Community Assembly Among Javanese And Balinese Freshwater Shrimps (Atyidae, Palaemonidae) Through Dna Barcodes ». Hydrobiologia 847 (2): 647 - 663. doi:10.1007/s10750-019-04127-7. http://link.springer.com/10.1007/s10750-019-04127-7.
-
. 2020. « Predicting Species Richness And Abundance Of Tropical Post-Larval Fish Using Machine Learning ». Marine Ecology Progress Series 645: 125 - 139. doi:10.3354/meps13385. https://www.int-res.com/abstracts/meps/v645/p125-139/.
Galerie d'images
Membres de l'équipe
Thèses en cours
Programmes
| 2019 - 2022 | DiadES |
| 2018 - 2021 | ANR ORCADEPRED |
| 2021 | POKER 5 |
| 2018 - 2021 | FRESHBIO |
| 2019 - 2021 | BENDICAM |
| 2020 | DIDILAC |
| 2020 | TRICHO2 |
| 2018 - 2020 | POEPA |
| 2017 - 2020 | REPCCOAI |
| 2014 - 2020 | FEAMP-DCF-Elasmo |
| 2020 | DIASYN |
| 2015 - 2020 | Programme Mélanésie-Hotspot |
| 2020 | Impact écosystémique des efflorescences d'espèces toxiques en lien avec les changements environnementaux et climatiques |
| 2016 - 2019 | Evo-Oeuf |
| 2017 - 2019 | TDSB Tropical Deep Sea Benthos |
| 2019 | TRICHO |
| 2017 - 2019 | ODYSSEUS |
| 2019 | CRUSTCAL |
| 2016 - 2019 | BIF |
| 2019 | STENO |
| 2019 | ComSaccu |
| 2017 - 2019 | HEDGE LEDGE |
| 2016 - 2019 | ATLASESOX |
| 2019 | MigGoby |
| 2013 - 2019 | Révision de la taxonomie ichtyologique en métropole |
| 2016 - 2018 | ANR TROPHIK |
| 2018 | Bichique |
| 2017 | POKER 4 |
| 2013 - 2017 | CaCHE |
| 2015 - 2016 | PIGE |
| 2012 - 2016 | ANR CHLORINDIC |
| 2012 - 2016 | ANR MYCTO 3D |
| 2014 | EcoGob |