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Sophie BERLAND
Ancien membre du laboratoire
Dans un contexte d’écologie fonctionnelle et d’évolution des systèmes biologiques en lien avec les problématiques de l’équipe « Biodiversité, plasticité, adaptation et conservation (BIOPAC) : caractérisation des signatures adaptatives et environnementales dans les systèmes biominéralisés.
Les structures biominéralisées ont une importance fonctionnelle globale et intégrative pour les organismes et constituent de fait des structures témoins de scénarios adaptatifs. Les molécules organiques, moteur de 'contrôle biologique', ainsi que la chimie minérale sont associées en systèmes dynamiques dans les structures biominéralisées et leur confèrent des propriétés de plasticité adaptative.
Les voies de recherche :
Approche structure-fonction-évolution des molécules associées aux systèmes minéralisant par la mise en œuvre de méthodes spectroscopiques développées dans les plateformes MNHN, sclérochronologie, microchimie NanoSIMS, géochimie Synchrotron.
Évolution des molécules du contrôle biologique des biominéralisations ( en particulier contrôle protéiques) par approche comparative de différentes lignées taxonomiques.
Analyse de la diversité́ des mécanismes éco-adaptatifs par signature microchimique dans différents systèmes biominéralisés carbonatés, en particulier : otolithe, coquille de mollusques, test de foraminifères.
Adaptation d’outils de bioinformatique aux métadonnées pour la compréhension des adaptations : scénarios de similarités/divergences ou la datation d’évènements de migration.
Mots clés : écologie fonctionnelle – biominéralisation – plasticité – adaptation– protéomique – microchimie– géochimie
Membre du conseil de Département
Membre du Conseil de l’Ecole doctorale MNHN-UPMC-SORBONNE UNIVERSITE ED 227 'Sciences de la Nature et de l’Homme : évolution et écologie'
Membre du réseau Assistance Prévention SST
Mes publications
2023
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Haÿ, Vincent , Sophie Berland, Kadda Medjoubi, Andrea Somogyi, Marion I Mennesson, Philippe Keith, et Clara Lord. 2023. « Unmasking Pipefish Otolith Using Synchrotron-Based Scanning X-Ray Fluorescenceabstract ». Scientific Reports 13 (1). doi:10.1038/s41598-023-31798-z. https://www.nature.com/articles/s41598-023-31798-z.2023 SciReportPipefish.pdf (1.98 Mo)
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Haÿ, Vincent , Sophie Berland, Kadda Medjoubi, Andrea Somogyi, Marion I Mennesson, Philippe Keith, et Clara Lord. 2023. « Unmasking Pipefish Otolith Using Synchrotron-Based Scanning X-Ray Fluorescenceabstract ». Scientific Reports 13 (1). doi:10.1038/s41598-023-31798-z. https://www.nature.com/articles/s41598-023-31798-z.
2020
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Clark, Melody S, Lloyd S Peck, Jaison Arivalagan, Thierry Backeljau, Sophie Berland, Joao CR Cardoso, Carlos Caurcel, et al. 2020. « Deciphering Mollusc Shell Production: The Roles Of Genetic Mechanisms Through To Ecology, Aquaculture And Biomimetics. ». Biol Rev Camb Philos Soc. doi:10.1111/brv.12640.
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Arivalagan, Jaison , Benjamin Marie, Giovanni Chiappetta, Joëlle Vinh, Xavier Gallet, Matthieu Lebon, Saloua M'Zoudi, Philippe Dubois, Sophie Berland, et Arul Marie. 2020. « Deciphering Shell Proteome Within Different Baltic Populations Of Mytilid Mussels Illustrates Important Local Variability And Potential Consequences In The Context Of Changing Marine Conditions ». Science Of The Total Environment 745: 140878. doi:10.1016/j.scitotenv.2020.140878. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969720344077.STOTEN_Arivalagan_et_al_2020.pdf (3.96 Mo)
2017
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Marie, Benjamin , Jaison Arivalagan, Lucrèce Mathéron, Gérard Bolbach, Sophie Berland, Arul Marie, et Frédéric Marin. 2017. « Deep Conservation Of Bivalve Nacre Proteins Highlighted By Shell Matrix Proteomics Of The Unionoida Elliptio Complanata And Villosa Lienosa ». Journal Of The Royal Society Interface 14. doi:10.1098/rsif.2016.0846. http://rsif.royalsocietypublishing.org/content/14/126/20160846.
2016
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Arivalagan, Jaison , Benjamin Marie, Victoria A Sleight, Melody S Clark, Sophie Berland, et Arul Marie. 2016. « Shell Matrix Proteins Of The Clam, Mya Truncata: Roles Beyond Shell Formation Through Proteomic Study ». Marine Genomics 27: 69-74. doi:http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2016.03.005. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874778716300186.
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Sleight, Victoria A, Michael AS Thorne, Lloyd S Peck, Jaison Arivalagan, Sophie Berland, Arul Marie, et Melody S Clark. 2016. « Characterisation Of The Mantle Transcriptome And Biomineralisation Genes In The Blunt-Gaper Clam, Mya Truncata ». Marine Genomics 27: 47 - 55. doi:http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2016.01.003. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874778716300034.
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Arivalagan, Jaison , Yarra Teja, Benjamin Marie, Victoria A Sleight, Evelyne Duvernois‐Berthet, Melody S Clark, Arul Marie, et Sophie Berland. 2016. « Insights From The Shell Proteome: Biomineralization To Adaptation. ». Mol Biol Evol. doi:10.1093/molbev/msw219.
2015
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Marie, Benjamin , Jaison Arivalagan, Lionel Dubost, Sophie Berland, Arul Marie, et Frédéric Marin. 2015. « Unveiling The Evolution Of Bivalve Nacre Proteins By Shell Proteomics Of Unionoidae. ». Dans Biomineralization: From Fundamentals To Biomaterials & Environmental Issues, Key Engineering Materials, 978-3-03835-591-5 Trans Tech Publications Ltd, 672:pp.158-167.
2014
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Sabbatini, A , L Bedouet, A Marie, A Bartolini, L Landemarre, M X Weber, Gusti Ngurah Kad I Mahardika, Sophie Berland, F Zito, et M-T Vénec-Peyré. 2014. « Biomineralization Of Schlumbergerella Floresiana, A Significant Carbonate-Producing Benthic Foraminifer. ». Geobiology 12 (4): 289-307. doi:10.1111/gbi.12085.