Dynamique spatio-temporelle et habitats des communautés zooplanctoniques : caractérisation de l’état écologique des écosystèmes pélagiques français

Le plancton est une composante essentielle du domaine pélagique. Il comprend l’ensemble des organismes végétaux (phytoplancton) et animaux (zooplancton) vivant dans la colonne d’eau qui présente une relative passivité vis-à-vis des mouvements des masses d’eau. Les organismes planctoniques sont ainsi particulièrement sensibles aux modifications des conditions environnementales (hydrodynamiques, hydrologiques, physico-chimiques, biologiques) qui peuvent impacter à la fois leur structure (e.g. composition, spectre de taille, diversité) et leur distribution (e.g. horizontale, verticale). Ces variations spatio-temporelles des communautés peuvent conditionner le fonctionnement du réseau trophique (e.g. chaîne trophique phytoplancton-herbivore ; reminéralisation) et l’équilibre des cycles biogéochimiques. Le plancton constitue par conséquent une composante de choix pour étudier et surveiller l’évolution des écosystèmes marins.



Ce travail de thèse s’inscrit à l’interface recherche et gestion puisqu’il s’agira de :

1. Caractériser les assemblages zooplanctoniques le long des façades Manche, Atlantique et Méditerranée afin d’identifier des sites/ périodes à enjeux (e.g. hotspot d’abondance, de biomasse, de diversité) dans les écosystèmes étudiés ; 
2. Analyser les variations de ces assemblages en réponse aux forçages physiques, hydrologiques, hydrographiques et climatiques, à différentes échelles spatiales et temporelles tout en considérant différents niveaux d’intégration écologique (espèces, communautés, groupes fonctionnels, stocks) ; 
3. Développer et/ou adapter des indicateurs permettant de détecter des changements et de quantifier les variations observées dans les  communautés zooplanctoniques (structure, types fonctionnels, diversité etc.) en appui aux politiques publiques (en particulier dans le cadre de la Directive Cadre Stratégie Milieu Marin) ; 
4. Evaluer l’état écologique des habitats pélagiques des façades littorales françaises (Descripteur 1 – Biodiversité de la DCSMM) et envisager des mesures d’aide à la gestion dans le cas d’état dégradé.