MitoPlancton

Période
2023
Equipe(s)
BIOPAC
EMERGE
Type de financement
Intra-unité
Collaboration scientifique
Amérique du Sud
Contact(s)

Evolution des mitogénomes obtenus par la méthode de PCR longue chez les éléments dominants du plancton de Bolivie et de Nouvelle-Calédonie (Boeckella, Laevicaudata et Spinicaudata)

Description

L’objectif de ce projet est de mettre en place une méthodologie nouvelle, déjà testée chez les poissons et permettant d’accéder à une information génétique assez complète à coût réduit permettant l’obtention de la totalité du mitogénome après 3 PCRs longues. Nous chercherons à l’appliquer chez des éléments planctoniques emblématiques (surtout Boeckella, mais aussi Leptestheria, Montelimnadia et Lynceus). Cette approche est basée sur les récoltes dans deux régions géographiques ayant une histoire différente. Elle s’accompagne d’un effort de prospection renouvelé aussi bien en Bolivie (région de La Paz et le Lac Titicaca) qu’en Nouvelle-Calédonie (Belep, Poum, Parc de la Rivière Bleu). Ce projet ouvre directement sur une application à l’ADNe en Bolivie, complémentaire de ce qui est en cours sur les poissons. Il a aussi pour vocation de mettre en place un outil ayant une portée beaucoup plus large géographiquement. Notamment, en Australasie pour le Lynceus, en Amérique du sud pour le Montelimnadia et le Leptestheria et surtout dans l’ensemble de l’Hémisphère sud pour le Boeckella.

Partenaires
  • Ibanez, Carla, Jeunes Equipes FERREIA, Chercheure en accord MCF UPEA Bolivie
  • Molina, Carlos, ChercheurUMSA -FCPN, Bolivie
  • Flores Ana, Assistant de laboratoire, Bolivie
  • Pinto Julio, Professeur et chercheur, Institut d'écologie Responsable du laboratoire de zooplancton, Bolivie 
  • Nicolas Charpin, Vies d’O, Correspondant Spécialiste des eaux-douces en Douce MNHN Nouvelle-Calédonie