NGSDISPER24

Période
2024
Equipe(s)
BIOPAC
EMERGE
PHYPAQ
RECAP
SOMAQUA
Type de financement
Intra-unité
Contact(s)

Séquençage NGS collectif pour l’axe Migration, dispersion des organismes aquatiques 2024

Description

Pour l’axe transversal MIgration, DIspersion des organismes aquatiques (MIDI), nous proposons de continuer le projet collaboratif à l’échelle de l’UMR en renouvelant un séquençage collectif mais avec des nouveautés significatives. Après deux années de réalisation nous avons pu dresser un bilan avec l’ensemble des participants et cerner des améliorations. La nouvelle stratégie devrait permettre de résoudre les problèmes observés qui sont liés au prestataire de séquençage (production de chimères par l’ICM). Cette année, l’idée est de monter en gamme dans le type de séquençage ce qui réduira l’offre (NovaSeq). Une discussion va être ouverte avec l’ICM pour comprendre le problème de genèse des chimères. L’intérêt de ce projet réside toujours dans l’accessibilité à la ressource de séquençage nouvelles générations avec selon les besoins l’accompagnement adapté. Il concerne donc les novices et les spécialistes mais avec une priorisation pour les projets émergents de l’UMR.