Rôle de la biodiversité microbienne intertidale dans le fonctionnement des sédiments

Les zones intertidales sont des écosystèmes situés à l’interface mer/ terre qui se caractérisent par une très forte productivité associée à de complexes interactions trophiques. Au sein de ces systèmes cohabitent une grande variété de micro-organismes benthiques liés par une complexe matrice de polymères extracellulaire d’origine biologique. Bien que le rôle de ces micro-organismes soit reconnu et associé à de nombreuses fonctions et services écologiques, peu de connaissances ont été amassées quant à la biodiversité au sein de ces populations et plus particulièrement de la diversité microbienne au sein des zones intertidales. L’objectif de cette thèse est d’identifier et de quantifier la diversité microbienne et microphytobenthique de différents types de sédiments et leur impact sur la composition et dynamique de la matrice polymérique extracellulaire, la stabilité des sédiments et la structuration du cycle du carbone à différents niveaux trophiques.