[Les Séminaires de l'ISYEB] Biodiversité des récifs coralliens : étude des dynamiques spatiale et temporelle du cryptobiom par Marion Couëdel, mardi 3 novembre 2020

Mardi 3 novembre,  les séminaires de l'ISYEB accueillent Marion Couëdel, en thèse à l'Université de la Réunion encadrée par Henrich Bruggemann de l'UMR Entropie, Agnès Dettai de l'ISYEB et Mireille Guillaume de BOREA sur :

" Biodiversité des récifs coralliens : étude des dynamiques spatiale et temporelle du cryptobiome ".

Résumé : 

La très petite faune des récifs coralliens est peu connue mais est cependant un indicateur précieux de la biodiversité et de sa dynamique. Ma thèse s'attache à explorer cette diversité dans les Mascareignes à travers des approches de métabarcoding et de barcoding moléculaire sur des structures artificielles standardisées, les ARMS (Autonomous Reef Monitoring Structures). Pour le métabarcoding, les biais d'amplification, de séquençage, mais également les méthodes d'assemblage, de clustering, et d'assignation montrent une très importante influence sur les résultats. Très peu de séquences sont finalement assignées, et la spécificité de la faune marine à La Réunion et Rodrigues nécessite la mise en place d'un référentiel barcode pour une meilleure interprétation des résultats du métabarcoding.

Contact : marion.couedel@univ-reunion.fr