Bienvenue aux nouveaux entrants
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Bienvenue aux nouveaux arrivants dans BOREA !
- Caroline Doose, a rejoint l'équipe SOMAQUA, en tant que chercheure contractuelle le 1er février 2021, à la Station de biologie marine/MNHN de Concarneau, sous la responsabilité de Cédric Hubas.
« Les biofilms sont des communautés de microorganismes appartenant à divers taxons (bactéries, champignons, algue et microméiofaune…) qui sont entourés d’une matrice de substances polymériques extracellulaires (EPS). Les difficultés rencontrées pour éradiquer le biofilm, notamment dans le contexte de l’industrie navale, sont souvent attribuées à la production de cette matrice d’EPS, jouant un véritable rôle de forteresse contre les agressions extérieures. La variété des stratégies d’adaptation des microorganismes, notamment aux antibiotiques, leur confère également une grande résistance.
Dans ce contexte il est donc important d’identifier des stratégies empêchant la formation du biofilm ou induisant sa dispersion et n’ayant pas d’effet néfastes sur l’environnement. Ainsi, notre projet s’intéresse plus particulièrement aux méthodes de dispersions passives apportées par les dernières avancées dans le domaine de la photonique, permettant la destruction du biofilm tout en assurant peu ou pas d’effet sur les écosystèmes marins.
Ainsi, les effets de plusieurs types de radiations (lumineuse, ionisante ou non) sur le biofilm, sa structure et son fonctionnement seront étudiés. Les changements induits, notamment au niveau de son métabolome et de sa photo-physiologie pourront être suivies grâce à diverses techniques analytiques telles que la GC et LC-MS. Les outils de biologie moléculaire tels que les NGS nous permettrons également de suivre les potentiels changements de structure taxonomique et d’expression du biofilm associés aux différentes radiations testées ».
Contact : caroline.doose@mnhn.fr
- Léa Vignaud, doctorante, a rejoint l’équipe RECAP, le 1e janvier 2021. Elle effectue sa thèse à l'Université des Antilles, co-encadrée par David Leccini (EPHE, CRIOBE) et Charlotte Dromard.
Titre du projet scientifique : « Recruitment and metamorphosis of reef fish post-larvae facing coastal anthropization in the Caribbean »
« Larval recruitment is an ecological process that corresponds to the return of post-larvae to the reef, after having undergone a pelagic phase. Once installed on the reef, they will undergo numerous physiological and morphological changes, corresponding to their metamorphosis, which is a primordial stage for their survival at this initial stage of their life. The aim of this thesis project is to study the metamorphosis of post-larvae during recruitment, and more particularly in relation to their nutrition, on six study sites that are contrasted in terms of anthropogenic impacts.During the first part of the thesis, a spatio-temporal study of the recruitment of post-larvae will be carried out in order to identify recruitment peaks during the year. We will also try to determine their larval life span (sclerochronology) The second part of the thesis will focus on the study of the metamorphosis of post-larvae in relation to their nutrition through: morphology (jaw and digestive system), isotopic niches, microbiology (intestinal microbial communities) and the study of hormones (thyroid hormones and glucocorticoids). Finally, the last part of the thesis will concern an in situ "transplantation" experiment allowing to follow the nutritional metamorphosis during radical changes in environmental conditions.The expected results of this thesis, funded by the LabEx CORAIL, are to relate the influence of anthropogenic pressures on the life traits of young recruits, which are essential for the renewal of the stocks of adult populations ».
Contact : lea.vignaud2@gmail.com
- Alexandre Carpentier, maître de conférences à l'Université de Rennes, a rejoint l’équipe BIOPAC le 1e janvier 2021 au CRESCO MNHN Dinard.
Titre du projet scientifique : « Ecologie fonctionnelle des relations poissons-habitats sur le continuum terre-mer »
« Mes recherches portent sur la caractérisation du fonctionnement des habitats marins côtiers en général et leurs fonctions pour l’ichtyofaune en particulier, dans le contexte des changements globaux et de la biologie de la conservation. Les stratégies individuelles, les capacités de dispersion des espèces et la description des réseaux trophiques sont les principaux traits biologiques utilisés afin d’évaluer la qualité des habitats écologiques essentiels et leur degré de connectivité. Pour cela nous étudions différents traceurs biologiques comme les isotopes stables et la microchimie des otolithes ainsi que les traits fonctionnels ou encore la sclérochronologie. Les modèles sont les espèces amphihalines (anguilles, mulets, flet), les espèces côtières (lançons, bar) mais aussi les communautés d’élasmobranches et en particulier les rajidés. Les habitats spécifiques sont les marais salés, les vasières, les estuaires tempérés, tropicaux, les côtes rocheuses ».
Contact : alexandre.carpentier@univ-rennes1.fr