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Magali ZBINDEN
Au sein de l'équipe AMEX, nous travaillons sur les écosystèmes chimiosynthétiques et notamment les sources hydrothermales, que l'on trouve le long des dorsales océaniques qui parcourent tous les océans du globe. Ces écosystèmes sont très particuliers, les fluides s’échappant des cheminées hydrothermales à 350°C sont anoxiques et constitués de composés chimiques réduits tels que sulfure, méthane, hydrogène et des métaux lourds. Les sites que nous étudions se trouvent entre 800 et 3600 mètres de profondeur : il n’y a pas de lumière et donc pas de photosynthèse. La matière organique à la base du réseau trophique est produite grâce à la chimiosynthèse, réalisée par des bactéries chimioautotrophes. Ces bactéries sont soit sous forme libre, soit en association avec des animaux, ce que l’on appelle la symbiose. Depuis dix ans, mes recherches se concentrent sur les animaux vivant avec des ectosymbiontes, c’est-à-dire des bactéries qui vivent à l’extérieur des tissus de leur hôte, contrairement aux endosymbiontes qui vivent dans les tissus de l'hôte. Mon animal de prédilection est la crevette Rimicaris exoculata. Dotée d'une tête (céphalothorax) hypertrophiée, la crevette y héberge une véritable "chambre de culture de bactéries".
L'étude de cette symbiose nous a permis de mettre en évidence une grande diversité morphologique, phylogénétique et métabolique des bactéries, ce qui permet à la crevette de coloniser différents sites dont les fluides ont des compositions chimiques très différentes. Nous avons également élucidé comment la crevette se nourrit. On savait depuis longtemps, grâce aux analyses des isotopes des tissus de l’animal, que la crevette se nourrit essentiellement grâce à ses bactéries. Mais la manière dont elle se nourrit restait un mystère. Grâce à des expériences in vivo dans des aquariums pressurisés IPOCAMPTM, nous avons pu mettre en évidence que l’animal ne se nourrit pas en « grattant » et ingérant ses bactéries, comme cela avait été largement suggéré, mais par diffusion de petites molécules organiques à travers sa cuticule. Un système assez étonnant car la cuticule des crustacés est généralement décrite comme imperméable !
Je travaille sur l’adaptation sensorielle chez les crevettes. Les sources hydrothermales profondes sont des écosystèmes relativement éphémères dépendants des activités volcaniques des dorsales océaniques et distants les uns des autres. La recherche de nouveaux sites hydrothermaux est donc un point crucial dans les phénomènes de dispersion et de colonisation de ces espèces. La dispersion et la colonisation se font généralement au stade larvaire. Mais les adultes, notamment Rimicaris exoculata, qui doit veiller à l'approvisionnement de ses symbiontes en composés chimiques, doivent également être capable de détecter les émissions de fluide. Les questions qui se posent sont nombreuses « quels sont les signaux captés par les animaux : température, concentration de sulfure, nourriture ? Quels sont les récepteurs impliqués et où sont-ils localisés?»
Nos derniers travaux (Machon et al. 2019; Ravaux et al; 2021) indique que l'olfaction ne serait pas le sens principal permettant la detection des sources. En revanche, la température pourrait être un attractant clé vers les sites.
Nous avons récemment débuté une nouvelle thématique sur la résilience des coraux d'eaux froides aux changements globaux (réchauffement, acidification). Grâce au développement d'aquarium pressurisés spécialement conçus pour la maintenance de ces coraux, nous allons étudier l'effet du réchauffement et de l'acidification sur la biologie de 3 espèces de coraux profonds: Desmophyllum pertusum, Madrepora oculata et Solenosmillia variabilis.
J’enseigne principalement la biologie des organismes sous forme de travaux dirigés et travaux pratiques, dans les modules de L2 (Biologie Animale) et L3 (Biologie Comparée et Evolution des Animaux). J'enseigne également en Ecologie (UE de L2 Ecologie et Evolution). Et j'enseigne en Master 1 (Mention Science de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité EcoPhysiologie / EcoToxicologie; UE Ecophysiologie).
Je réalise également des enseignements en relation avec les thématiques de recherche de notre équipe: UE de Licence 3 (IInteractions Durables, Ecologie et Evolution : du mutualisme au parasitisme ).
Je suis co-responsable de l'UE de L2- Biologie Animale, , et co-responsable de l'UE de L3- Interactions Durables, Ecologie et Evolution : du mutualisme au parasitisme .
Depuis 2023, je suis membre suppléant de la Commission Nationale de la Flotte Hauturière (CNFH).
Je suis Membre (élue) du Conseil d'Administration de l'UFR 927 de l'UPMC, et Membre (nommée) du Conseil d'Enseignement de l'UFR 927 de l'UPMC (mandats de 2013 à 2016)
Je suis également membre du vivier d’experts pour la section 68 et membre de la commission P.I.I.P de l'UPMC.
Mes publications
2020
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Machon, Julia , Jakob Krieger, Magali Zbinden, Juliette Ravaux, et Steffen Harzsch. 2020. « Exploring Brain Diversity In Crustaceans: Sensory Systems Of Deep Vent Shrimpsabstract ». Neuroforum. doi:10.1515/nf-2020-0009. https://www.degruyter.com/view/journals/nf/ahead-of-print/article-10.1515-nf-2020-0009/article-10.1515-nf-2020-0009.xml.
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Zbinden, Magali , et MA Cambon-Bonavita. 2020. « Rimicaris Exoculata: Biology And Ecology Of A Shrimp From Deep-Sea Hydrothermal Vents Associated With Ectosymbiotic Bacteria ». Marine Ecology Progress Series 652: 187 - 222. doi:10.3354/meps13467. https://www.int-res.com/abstracts/meps/v652/p187-222/.!Zbinden&Cambon 2020.pdf (12.38 Mo)
2019
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Machon, Julia , Jakob Krieger, Rebecca Meth, Magali Zbinden, Juliette Ravaux, Nicolas Montagné, Thomas Chertemps, et Steffen Harzsch. 2019. « Neuroanatomy Of A Hydrothermal Vent Shrimp Provides Insights Into The Evolution Of Crustacean Integrative Brain Centers ». Elife 8. doi:10.7554/eLife.47550.001. https://elifesciences.org/articles/47550.Machon et al. 2019 eLife.pdf (5.26 Mo)
2018
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Apremont, Vincent , Marie-Anne Cambon-Bonavita, Valérie Cueff-Gauchard, David François, Florence Pradillon, Laure Corbari, et Magali Zbinden. 2018. « Gill Chamber And Gut Microbial Communities Of The Hydrothermal Shrimp Rimicaris Chacei Williams And Rona 1986: A Possible Symbiosis ». Plos One 13 (11): e0206084. doi:10.1371/journal.pone.0206084. http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0206084.Apremont et al. 2018.pdf (3.31 Mo)
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Zbinden, Magali , Alison Gallet, Kamil M Szafranski, Julia Machon, Juliette Ravaux, Nelly Léger, et Sébastien Duperron. 2018. « Blow Your Nose, Shrimp! Unexpectedly Dense Bacterial Communities Occur On The Antennae And Antennules Of Hydrothermal Vent Shrimp ». Frontiers In Marine Science 5. doi:10.3389/fmars.2018.00357. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2018.00357/full.!Zbinden et al. 2018.pdf (4.08 Mo)
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Machon, Julia , Philippe Lucas, Juliette Ravaux, et Magali Zbinden. 2018. « Comparison Of Chemoreceptive Abilities Of The Hydrothermal Shrimp Mirocaris Fortunata And The Coastal Shrimp Palaemon Elegans ». Chemical Senses 43: 489-501. doi:10.1093/chemse/bjy041. https://doi.org/10.1093/chemse/bjy041.Machon et al. Chem Senses 2018.pdf (7.39 Mo)
2017
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Zbinden, Magali , C Berthod, N Montagné, J Machon, N Léger, T Chertemps, Nicolas Rabet, Bruce Shillito, et Juliette Ravaux. 2017. « Comparative Study Of Chemosensory Organs Of Shrimp From Hydrothermal Vent And Coastal Environments ». Chemical Senses doi:10.1093/chemse/bjx007: 1-13.Zbinden et al. Chem senses 2017.pdf (1.54 Mo)
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Hauton, Chris , Alastair Brown, Sven Thatje, Nélia C Mestre, Maria J Bebianno, Inês Martins, Raul Bettencourt, et al.. 2017. « Identifying Toxic Impacts Of Metals Potentially Released During Deep-Sea Mining—A Synthesis Of The Challenges To Quantifying Risk ». Frontiers In Marine Science 4: 368. doi:10.3389/fmars.2017.00368. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmars.2017.00368.Hauton et al. 2017.pdf (1.5 Mo)
2016
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Auguste, M , N Mestre, T Rocha, C Cardoso, V Cueff-Gauchard, S Le Bloa, M-A Cambon-Bonavita, et al. 2016. « Development Of An Ecotoxicological Protocol For The Deep-Sea Fauna Using The Hydrothermal Vent Shrimp Rimicaris Exoculata ». Aquatic Biology 175: 277-285. doi:https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2016.03.024.Auguste et al 2016.pdf (933.17 Ko)
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Machon, Julia , Juliette Ravaux, Magali Zbinden, et Philippe Lucas. 2016. « New Electroantennography Method On A Marine Shrimp In Water ». Journal Of Experimental Biology 219: 3696–3700. doi:10.1242/jeb.140947. https://jeb.biologists.org/content/219/23/3696.Machon J Exp Biol 2016.pdf (511.07 Ko)
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Ravaux, Juliette , Nelly Léger, Nicolas Rabet, Claire Fourgous, Guillaume Voland, Magali Zbinden, et Bruce Shillito. 2016. « Plasticity And Acquisition Of The Thermal Tolerance (Upper Thermal Limit And Heat Shock Response) In The Intertidal Species Palaemon Elegans ». Journal Of Experimental Marine Biology And Ecology 484: 39 - 45. doi:https://doi.org/10.1016/j.jembe.2016.07.003. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022098116301125.Ravaux et al 2016.pdf (868.08 Ko)
2015
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Durand, Lucile , Marie Roumagnac, Valérie Cueff-Gauchard, Cyrielle Jan, Mathieu Guri, Claire Tessier, Marine Haond, et al.. 2015. « Biogeographical Distribution Of Rimicaris Exoculata Resident Gut Epibiont Communities Along The Mid-Atlantic Ridge Hydrothermal Vent Sites. ». Fems Microbiol Ecol 91 (10). doi:10.1093/femsec/fiv101.
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Gaudron, Sylvie M, Lise Marqué, Eric Thiébaut, Pascal Riera, Sébastien Duperron, et Magali Zbinden. 2015. « How Are Microbial And Detrital Sources Partitioned Among And Within Gastropods Species At East Pacific Rise Hydrothermal Vents? ». Marine Ecology 36: 18-34. doi:10.1111/maec.12260. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/maec.12260.!2015-GaudronMAE.pdf (888.44 Ko)
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Marjolaine, Matabos , Cuvelier Daphné, Brouard Johan, Bruce Shillito, Juliette Ravaux, Magali Zbinden, Barthelemy Dominique, Pierre-Marie Sarradin, et Jozee Sarrazin. 2015. « Behavioural Study Of Two Hydrothermal Crustacean Decapods: Mirocaris Fortunata And Segonzacia Mesatlantica, From The Lucky Strike Vent Field (Mid-Atlantic Ridge) ». Deep Sea Research Part Ii: Topical Studies In Oceanography 121: 146 - 158. doi:https://doi.org/10.1016/j.dsr2.2015.04.008. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0967064515001113.!Matabos et al. 20154 Deep-sea Research.pdf (1.57 Mo)
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Shillito, Bruce , Juliette Ravaux, Jozee Sarrazin, Magali Zbinden, Pierre-Marie Sarradin, et Barthelemy Dominique. 2015. « Long-Term Maintenance And Public Exhibition Of Deep-Sea Hydrothermal Fauna: The Abyssbox Project ». Deep Sea Research Part Ii: Topical Studies In Oceanography 121: 137 - 145. doi:https://doi.org/10.1016/j.dsr2.2015.05.002. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0967064515001460.!Shillito et al 2015.pdf (389.31 Ko)
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Aznar-Cormano, L , J Brisset, T-Y Chan, Laure Corbari, N Puillandre, J Utge, Magali Zbinden, D Zuccon, et S Samadi. 2015. « An Improved Taxonomic Sampling Is A Necessary But Not Sufficient Condition For Resolving Inter-Families Relationships In Caridean Decapods. ». Genetica 143 (2): 195-205. doi:10.1007/s10709-014-9807-0.Aznar-Cormano et al. 2015.pdf (562.48 Ko)
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Zbinden, Magali , Lise Marqué, Sylvie M Gaudron, Juliette Ravaux, Nelly Léger, et Sébastien Duperron. 2015. « Epsilonproteobacteria As Gill Epibionts Of The Hydrothermal Vent Gastropod Cyathermia Naticoides (North East-Pacific Rise) ». Marine Biology 162 (2): 435-448. http://link.springer.com/article/10.1007/s00227-014-2591-7#.