Ils/Elles ont rejoint l'UMR BOREA en septembre et octobre 2015 :
Bienvenue à tous et toutes !
- Maëva Cherif-Feildel, doctorante, est arrivée dans l'équipe 2 à Caen le 1er septembre 2015.
Titre du projet scientifique : Structure et fonctionnement de la niche germinale chez un hermaphrodite alternatif, l’huître creuse Crassostrea gigas
« Mes travaux de recherche portent sur la structure, le fonctionnement de la niche germinale et l’implication du signal insuline chez Crassostrea gigas (lophotrochozoaire, mollusque). L’originalité de ce modèle tient dans l’extrême plasticité de la niche germinale, capable de générer alternativement une lignée mâle ou femelle chez un même individu (hermaphrodisme alternatif). Lors de cette thèse, nous nous intéresserons aux cellules germinales souches (CGS), à leur microenvironnement (niche germinale) ainsi qu’aux acteurs du système insuline qui assurent, par une action paracrine, un contrôle sur le devenir des cellules souches. L’ensemble de ces acteurs sera identifié et leur expression caractérisée au sein de la niche. En outre le maintien de la pluripotence des CGS en lien avec une production locale d’insuline est retrouvé chez de nombreuses espèces. Si ce contrôle paracrine est confirmé chez les lophotrochozoaires, il apparaitrait comme fondamentalement conservé d’un point de vue évolutif ».
Contact : maeva.cherif-feildel@unicaen.fr
- Jérémy Pasquier, ATER, est arrivé le 1er septembre 2015 au sein de l’équipe 2 à Caen.
Contact : jeremy.pasquier@unicaen.fr
- Marine Robuchon, ATER, a rejoint l’équipe 7 à Paris le 1er septembre 2015 :
« Mes travaux de recherche portent sur la dynamique de la biodiversité. Je m’intéresse en particulier aux patrons de biodiversité à différents niveaux d’organisation (diversité génétique et spécifique) et sous différentes facettes (diversité phylogénétique et fonctionnelle) pour comprendre comment les processus historiques et contemporains, y compris les pressions anthropiques, façonnent ces patrons de biodiversité. Je m’intéresse à ces questions en étudiant différents organismes aquatiques, les macroalgues marines et les poissons d’eau douce ».
Contact : robuchon@mnhn.fr
- Valentin Seizilles de Mazancourt, doctorant, rattaché aux équipes 1 et 4, Paris, est arrivé le 1er octobre 2015 .
« Dans le cadre de mon travail de recherche, je m'intéresse à la systématique des crustacés amphidromes, et plus particulièrement aux crevettes du genre Caridina (Atyidae) du point de vue de la taxonomie comme de la phylogénie. Au sein de ce genre je m'occupe de deux complexes d'espèces, le complexe Caridina nilotica et le complexe Caridina weberi, groupes d'espèces taxonomiquement confus. Le but de mon travail est, d'une part, de résoudre les problèmes taxonomiques en proposant des délimitations nettes entre les espèces mises en évidence par la taxonomie intégrative (utilisation de caractères morphologiques, génétiques, écologiques, biologiques, phylogéographiques...) et d'autre part, de mettre au point une méthode de sclérochronologie appliquée à ces crevettes permettant de mieux connaître leurs traits de vie liés à la dispersion, dans un but d’aider les gestionnaires à mettre en place la conservation ou l'exploitation durable de ces espèces et de leurs milieux. Je suis donc amené, dans mon travail, à mettre en œuvre des techniques de pointe dans les domaines de la génétique ou de la sclérochronologie ».
Contact : valentin.demazancourt@laposte.net
- Ali Mcheik a rejoint l'équipe 1 le premier octobre 2015.
Titre du projet scientifique : Etude des propriétés optiques des cristaux photoniques naturels (diatomées) pour des applications photovoltaïques
« Les diatomées, des micro-algues unicellulaires (échelle µm à mm), développent des structures des coquilles fascinantes à base de dioxyde de silicium (SiO2). Ces structures appelées frustules, répondent à plusieurs besoins des diatomées principalement optique (photosynthèse) et mécanique (protection). Mes recherches portent sur l'étude des propriétés optiques de certaines diatomées à vision d'applications photovoltaïques potentielles. Une modification des structures (Tailles des pores, dopage..) est nécessaire afin d'atteindre l'objectif ».
- Aurora Campo, doctorante, a rejoint l’équipe 2 à Paris le 1er octobre 2015.
Titre du projet scientifique : Characterization of novel brain neuropeptides and their receptors in eel and potential applications in fish breeding programs
« Mon projet de thèse vise à découvrir de nouveaux neuropeptides et de nouveaux récepteurs chez l’anguille, de revoir leur classification et d’étudier leurs rôles, avec une attention particulière pour les gènes dupliqués conservés. Ces neuropeptides peuvent devenir de nouveaux outils pour lever le blocage prépubertaire de l’anguille et avoir des applications potentielles dans les programmes d’élevage/reproduction non seulement chez cette espèce mais aussi chez d’autres espèces de poissons. Les objectifs de ce projet de thèse sont multiples : 1. Prédire in silico les séquences de nouveaux neuropeptides et de leurs récepteurs; les valider par clonage ; 2. Réaliser des analyses phylogénétiques et synténiques de ces familles de neuropeptides et de récepteurs ; 3. Identifier et valider ces nouvelles séquences par protéomique ; produire les peptides synthétiques ; 4. Caractériser fonctionnellement les couples peptide/ récepteur par des méthodes recombinantes ; 5. Développer des dosages qPCR pour étudier la régulation in vivo et in vitro de l’expression de ces gènes; 6. Rechercher les activités biologiques (in vivo et in vitro) dans le contrôle neuroendocrine de la reproduction de ces nouveaux neuropeptides ; les approches in vivo se feront en collaboration avec les partenaires du réseau européen ITN IMPRESS ».
Contact : ayla.bcn@gmail.com
- Bérénice Piquet, doctorante, a rejoint l'équipe AMEX, équipe 3 de BOREA le 1er octobre 2015.
Titre du projet scientifique : FLEXSYBI : La FLEXibilité des SYmbioses entre BIvalves et bactéries chimiotrophes : mécanismes, régulation et résilience.
« Lors de ma thèse, je vais étudier des moules du genre Bathymodiolus (Bivalvia : Mytilidae) qui abritent dans leurs branchies des bactéries chimiotrophes. Cette symbiose permet aux moules de coloniser des milieux contraignants comme les sources hydrothermales et les suintements froids. En utilisant le méthane et/ou le sulfure comme source d’énergie, les symbiotes synthétisent des glucides qui sont la principale source d’alimentation de leurs hôtes. Cette symbiose étant flexible, mon but sera d’éclairer les mécanismes qui la régulent. Comment l’hôte régule-t-il la quantité de bactéries présentes dans ses branchies (Apoptose, endo-exocytose, digestion des bactéries,…) ? Les bactéries sont-elles capables d’échapper à leur hôte ? Pour répondre à ces questions différentes méthodes vont être utilisées, en histologie (Immunohistologie, microscopie à transmission, FISH, TUNEL, BrdU,…) mais aussi en transcriptomique afin d’identifier les voies responsables de ces régulations. Cette thèse se déroulera entre deux équipes : l’équipe ABICE de l’UMR 7144 à la Station Biologique de Roscoff et l’équipe AMEX de l’UMR 7208 BOREA sur le Campus de l’UPMC ».
Contact : berenicepiquet@gmail.com
- Julia Machon, doctorante, a rejoint également l'équipe 3 à Paris le 1er octobre.
Titre du projet scientifique : Adaptations sensorielles chez les crevettes hydrothermales profondes : comparaison des facultés sensorielles de la crevette hydrothermale Mirocaris fortunata et de la crevette côtière Palaemon elegans
« I work on sensorial abilities and potential adaptations of the deep hydrothermal shrimp Mirocaris fortunata (Alnivocarididae) from the Mid-Atlantic ridge.
The sensory capacities of hydrothermal species are still poorly known, despite their importance for understanding their life cycles and long-term evolution. This PhD aims at determining the processes involved in the detection of the environment, in order to locate food sources and fluid emissions for example. In a socio-economic context where hydrothermal vents are the mining industries targets, better understanding these processes is necessary to evaluate the vulnerability of hydrothermal species to potential environmental disturbances from mining operations. The related coastal shrimp Palaemon elegans will be used for comparison and for optimizing methods. The study will focus on chimio- and thermo-reception, with additional approaches in morphology, behavior, electrophysiology and molecular biology. This project is part of the MIDAS (Managing Impacts of Deep-Sea Resource Exploitation) European project, and will be conducted in collaboration with the iEES team (UMR PISC 1272).
».
Contact : julia.machon@live.fr
- Laetitia Petit, Ingénieure, est arrivée elle dans l'équipe 5 le 1er octobre.
« D’octobre 2015 à mai 2016, j’occuperai un poste de « chargée de mission » pour le D4 de la DCSMM (Directive cadre stratégie pour le milieu marin) à l’UMR BOREA (Caen) avec un accent plus marqué sur les travaux internationaux apportant un appui au D4. Je co-animerai avec Nathalie Niquil le groupe d’experts européens sur les réseaux trophiques dont les travaux se focalisent actuellement sur le développement d’indicateurs de biodiversité qui soient communs aux différents états membres de l’UE ».
Contact : laetitia.petit@unicaen.fr
- Aurore Sauvey, doctorante, est dans l'équipe 5 depuis le 1er octobre 2015 également.
Titre du projet scientifique : Variabilité inter-spécifique et intra-spécifique des réponses physiologiques chez les diatomées toxiques du genre Pseudo-nitzschia : influence du cycle de vie
« Ce projet de recherche propose de caractériser la diversité inter-spécifique et intra-spécifique chez les diatomées du genre Pseudo-nitzschia. Les objectifs sont donc: 1) étudier la reproduction sexuée chez quatre espèces et obtenir des cultures à différents stades du cycle de vie et 2) caractériser différents indices physiologiques (taux de croissance, paramètres photosynthétiques, constantes d’absorption des éléments nutritifs, production d’acide domoïque) chez différentes souches pour chaque espèce, à différents stades du cycle de vie. Les indices physiologiques obtenus permettront une meilleure paramétrisation des modèles écophysiologiques de développement de Pseudo-nitzschia et de production de toxine en intégrant la diversité spécifique. Ce projet apportera de plus des connaissances sur les régulations physiologiques associées au cycle de vie chez les diatomées en général et la variabilité de ces réponses aux échelles intra et interspécifiques ».
Contact : auroresauvey@gmail.com
- Mitchell Fleming, doctorant est arrivé le 7 octobre 2015 pour des recherches dans l’équipe 2 à Paris.
Titre du projet scientifique : Environmental and neuroendocrine control of metamorphosis and swimming activity in long-river (Loire-Allier axis) Atlantic salmon; implication for conservation
« Mon projet de thèse vise à élucider les mécanismes environnementaux et neuroendocrines de la smoltification et de la migration de dévalaison et à évaluer l’impact des changements globaux. Les objectifs sont: a) de caractériser le contrôle neuroendocrine de l’induction de la métamorphose secondaire du saumon (smoltification); b) d’étudier le contrôle cérébral du comportement de nage de dévalaison; et c) d’évaluer l’effet de la température sur la régulation neuroendocrine de la métamorphose et du comportement de nage. Les méthodes utilisées seront les suivantes : a) Biologie moléculaire : identification de gènes (neuropeptides et récepteurs), clonage, analyse d’expression de gènes par qPCR; b) Etude de la smoltification : paramètres anatomiques, physiologiques et neuroendocrines c) Etude de la migration : tests de comportement de nage; d) Expériences in vitro en cultures cellulaires (sur cultures primaires de cellules hypophysaires de saumon); e) Expériences in vivo (effet de la variation de température) ».
Contact : mitch.s.fleming@gmail.com
- Julie Schwartz, doctorante, a rejoint l'équipe 2 sur le site de Caen depuis le 12 octobre 2015.
Titre du projet scientifique : Caractérisation de voies neuroendocriniennes du contrôle de la physiologie chez l'huître par la caractérisation fonctionnelle de couples récepteurs /neuropeptides